烟草MITE位点间多态性(IMP)标记开发及其遗传作图应用.pdfVIP

浙江大学学报(农业与生命科学版)38(6)：655～661，2012 Journalof Sci．) ZhejiangUniversity(Agric．Life http：／／www．joumals．zju．edu．cn／agr E-mail：zdxbnsb@zju．edu．cn 烟草MITE位点间多态性(IMP)标记开发及其遗传作图应用 高玉龙1，桂毅杰2， 肖炳光P，薄世平2，严广号2，樊龙江2 (1．云南省烟草农业科学研究院，云南玉溪653100；2．浙江大学农业与生物技术学院农学系，浙江杭州310058) 摘要 为在烟草(Nicotianatabacum)上进行IMP(inter．MITE inverted 美国烟草基因组测序数据和MITE(miniature element，微型反向重复转座元件)结构特 repeattransposable 征，通过生物信息学方法获得11 inverted 581组具有特异TIR(terminal repeat，末端重复元件)序列的MITET殳其多 序列联配结果，并根据联配结果设计219条烟草IMP引物；利用9个不同类型烟草代表性品种进行测试，其中119 进行标记筛选，共获得29个多态性标记，群体检测表明有21个标记可以整合定位到一个SSR标记遗传连锁图上．说 明IMP标记在烟草中是一种可以利用的分子标记，但跟其他标记一样表现出较低的多态性，需高通量检测平台与 之配套来提高其开发效率． 关键词 烟草；微型反向重复转座元件(MITE)；MITE位-点间多态性(IMP)；分子标记；遗传图谱 中图分类号 Q78 文献标志码 A of and in tobaccointer-MITE its Development polymorphism(IMP)markersapplicationgenetic mapping．JournalofZhejiangUniversity(Agric．LifeSci．)，2012，38(6)：655-661 GAO Yu．10n91，GUIYi-jie2，XIAOBing．guan91’，BOShi．pin92，YANGuang—ha02，FANLong-jian92(』．Yunnan Tobacco Sciences，Yuxi，Yunnan Academyof Agricultural 653100,China；2．DepartmentofAgronomy,Collegeof Agriculture＆Biotechnology,ZhejiangUniversity,Hangzhou310058,China) DNA elementsthe an elementfor fromautonomous Summarytransposablerequiretransposase parent transposition． ofMITEs Thecharacteristicare lessthan500withterminalinverted site generally bp