成功的在小的點陣模型應用了這個概念.docVIP

蛋白質摺疊與聚集 文/張家靖 關鍵字： 似一階態轉變模型 (First-order-like state transition model)、蛋白質摺疊(protein folding)、熵驅動力(entropically force)、直接摺疊路徑(Direct folding path, off-path)、過臨界點摺疊路徑(over-critical reaction path, on-path)、擴散限制性聚集反應(diffusion limited aggregation)。 蛋白質為由多種胺基酸，依不同比例聚合而形成特殊構型之鍊狀聚合物。蛋白質構型的變化與其功能之改變有著密切的影響。蛋白質是如何由一無特定構型鬆散之鍊狀物摺疊至緊緻且具特殊構型之過程，與其間分子內結構變化及分子間交互作用，則是我們所亟欲了解之課題。我們發現蛋白質整體摺疊反應與似一階態轉變模型有著極高的吻合性。此外我們亦發現蛋白質在直接摺疊路徑中會發生聚集沉澱之現象，藉由實驗與模擬研究發現，這類聚集沉澱過程與分子擴散限制性聚集反應有關。此一發現對研究蛋白質摺疊動力學有著重要的影響。 蛋白質：介觀(mesoscopic)系統蛋白質為一富含大量胺基酸，由數百個至數千個原子所組成的複雜生物巨分子。因此透過微觀的全原子解析方式將很難完整的分析將此系統瞭解。然而此一分子並非一巨觀系統，所以蛋白質可以視為一個介