生物信息学用于代谢网络的研究的进展和展望.pdfVIP

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  • 2016-04-03 发布于安徽
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生物信息学用于代谢网络的研究的进展和展望.pdf

 第 55 卷  第 10 期           化    工    学    报         Vol 55  №10 ( )   2004 年 10 月      Journal  of  Chemical  Industry  and  Engineering   China    October  2004 综述与专论 生物信息学用于代谢网络 研究的进展与展望 1 1 ,2 1 1 1 ,2 何  锋  马红武  赵学明  元英进  曾安平 (1 天津大学化工学院 , 天津 300072 ; 2 GBFGerman Research Center for Biotechnology , Mascheroder Weg 1 , 38124 Braunschweig , Germany) 摘 要  如何分析基因测序和高通量分析方法所获得的海量数据和信息 , 及由此而得到的复杂生物网络 , 是生 物信息学研究者所面临的重要任务. 本文综述了基于基因组的大规模代谢网络重建和分析的进展 , 论述了利用 生物信息学方法分析代谢网络结构的主要方法和结果 ; 比较了现阶段两种最常用的代谢途径分析方法, 即基元 模式和极端途径的差异 ; 列举了这两种方法在代谢网络结构和功能分析、工程菌设计等多方面的重要应用 ; 指 出了现阶段在途径分析领域存在的问题和应对的策略. 关键词  生物信息学  基因组学  代谢网络  代谢途径  基元模式  极端途径 中图分类号 TQ 9201  Q 8114     文献标识码  A 文章编号  0438 - 1157 (2004) 10 - 1593 - 09 PRO GRESS AND PERSPECTIV E IN APPL ICA TION OF BIOIN FORMA TICS TO ANAL YSIS OF M ETABOL IC N ETWOR KS HE Feng1 , MA Hongwu1 ,2 , ZHAO Xueming1 , YUAN Yingjin 1 and ZEN G Anping1 ,2 (1 School of Chemical Engineering and Technology , Tianjin U niversity , Tianjin 300072 , China ; 2 GB FGerm an Research Center f or Biotechnology , M ascheroder Weg 1 , 38124 B raunschweig , Germ any) Abstract  One of the challenges of contemporary bioinformatics is how to make use of the large volume of data and

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