生物信息学用于代谢网络的研究的进展和展望.pdfVIP

　第 55 卷 　第 10 期 　　　　　　　　　　化 　　　工 　　　学 　　　报 　　　 　　　　Vol 55 　№10 ( ) 　 2004 年 10 月 　　　　　Journal 　of 　Chemical 　Industry 　and 　Engineering 　 China 　 　October 　2004 综述与专论 生物信息学用于代谢网络 研究的进展与展望 1 1 ,2 1 1 1 ,2 何 　锋 　马红武 　赵学明 　元英进 　曾安平 (1 天津大学化工学院 , 天津 300072 ; 2 GBFGerman Research Center for Biotechnology , Mascheroder Weg 1 , 38124 Braunschweig , Germany) 摘　要 　如何分析基因测序和高通量分析方法所获得的海量数据和信息 , 及由此而得到的复杂生物网络 , 是生 物信息学研究者所面临的重要任务. 本文综述了基于基因组的大规模代谢网络重建和分析的进展 , 论述了利用 生物信息学方法分析代谢网络结构的主要方法和结果 ; 比较了现阶段两种最常用的代谢途径分析方法, 即基元 模式和极端途径的差异 ; 列举了这两种方法在代谢网络结构和功能分析、工程菌设计等多方面的重要应用 ; 指 出了现阶段在途径分析领域存在的问题和应对的策略. 关键词 　生物信息学 　基因组学 　代谢网络 　代谢途径 　基元模式 　极端途径 中图分类号　TQ 9201 　Q 8114 　　　　文献标识码 　A 文章编号 　0438 - 1157 (2004) 10 - 1593 - 09 PRO GRESS AND PERSPECTIV E IN APPL ICA TION OF BIOIN FORMA TICS TO ANAL YSIS OF M ETABOL IC N ETWOR KS HE Feng1 , MA Hongwu1 ,2 , ZHAO Xueming1 , YUAN Yingjin 1 and ZEN G Anping1 ,2 (1 School of Chemical Engineering and Technology , Tianjin U niversity , Tianjin 300072 , China ; 2 GB FGerm an Research Center f or Biotechnology , M ascheroder Weg 1 , 38124 B raunschweig , Germ any) Abstract 　One of the challenges of contemporary bioinformatics is how to make use of the large volume of data and