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- 2016-11-10 发布于安徽
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characterizationofcancergenomes.ppt
characterization of cancer genomes NAME:潘采芹 试验设计与策略 理想情况下,分析选择是由研究生物表形来指导。然而,技术细节和限制也影响实验设计。,在设计屏幕时,重要的考虑因素是:测定是否真正地概括了所感兴趣的表型和测定是否足够坚固,以检测在实验条件下的差别。 实验格式: 排列和混合格式(figure2): 可用于高通量筛选,有明显的优点,但也有限制 虽然排列格式屏幕是强大的,但成本和复杂性的表现大屏幕的限制他们的应用 排列格式的实验涉及筛选在空间上分开的井或斑点,每个包含单一的试剂(例如,siRNA的,ORF或化学的)的阵列。这些实验使用微型表型或特异性读数(figure1) figure2 实验涉及筛选一个每个数组的空间隔离井或斑点小干扰RNA,包含一个试剂 figure1 非哺乳动物模型生物,功能缺失屏幕通常通过比较执行相同的细胞在不同实验条件下或通过比较相差一个等位基因的细胞。然而,相当大的异质性,是在哺乳动物系统固有的限制的力量主屏幕进行配对细胞系明确识别基因的功能区分两类(box2) 另外,高通量,混合格式筛选实验在大板特征明显的细胞系提供增强的影响力来确定真正的阳性 box1 box2 化验 最常见的测量癌症表型增殖和生存,而这些表型已经使用在开发方法和试剂的概念验证实验。.例如,shRNA库已经部署在排列格式屏幕调查生产
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