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7．补充养老保险、补充医疗保险的扣除 　　按照财税［2009］27号的规定，企业为在本企业任职或受雇的全体员工支付的补充养老保险费、补充医疗保险费，分别在不超过职工工资总额　　5%标准内的部分，在计算应纳税所得额准予扣除。 　　因此，为部分员工支付的不得从税前扣除。 六、跨地区经营汇总纳税 （一）文件适用范围 57号公告增加了中国投资有限责任公司、中国信达资产管理股份有限公司和中国长江电力股份有限公司,并对国有邮政企业、海洋石油天然气企业这两类企业不执行汇总纳税企业征收管理办法的具体范围作出了明确，且特别强调铁路运输企业所得税征收管理不适用汇总纳税企业征收管理办法。 （二）税款预缴时参与计算分配税款比例的三因素所属时间产生差异 原28号文件规定跨省市总分机构企业分支机构1—6月份按上上年三因素指标数据参与分配税款，7-12月份按上年三因素指标数据计算分配税款的比例。 57号公告则规定跨省市总分机构企业分支机构按上年三因素指标数据计算分配税款的比例。 （三）汇算清缴 原28号文规定，各分支机构不进行企业所得税汇算清缴，统一由总机构按照相关规定进行汇算清缴，且统一进行补、退税工作，补缴税款统一缴入中央国库，所退税款也由中央国库支出。 57号公告则规定，汇总纳税企业由总机构汇总计算企业年度应纳所得税额，扣除总机构和各分支机构已预缴的税款，计算出应缴应退税款，分别由总机构和各分支机构（不包括当年已办理注销税务登记的分支机构）按三因素计算出的分配税款比例将分配税款就地办理税款缴库或退库，补缴税款按规定比例分别缴入中央国库和地方金库，所退税款按规定比例分别由中央国库和地方金库支出或经总、分机构同意后分别抵缴其下一年度应缴企业所得税税款。 （四）查补税款 原28号文未对汇总纳税企业主管税务机关进行税务检查事项作出较为详细的规定。 57号公告则对汇总纳税企业主管税务机关进行税务检查的方式，所产生的查补税款（包括滞纳金、罚款）如何分配入库等事项做出了较为详细的规定。 （五）分支机构汇算清缴 　　国家税务总局公告2013年第44号规定，跨地区经营汇总纳税企业的二级分支机构，在进行2013年度及以后年度纳税申报时，暂用《中华人民共和国企业所得税月（季）度预缴纳税申报表（A类）》格式进行年度纳税申报。分支机构在办理年度所得税应补（退）税时，应同时附报《中华人民共和国企业所得税汇总纳税分支机构分配表》。 月 * 国家税务总局公告2012年第15号明确： 企业取得的不征税收入，应按照财税［2011］70通知的规定进行处理，凡未按规定进行管理的，应作为企业应税收入计入应纳税所得额，依法缴纳企业所得税 释：对于未按照财税［2011］70号文规定进行管理作为应税收入处理的财政性资金，其发生的支出可以按税法规定从税前扣除；如支出符合研究开发费加计扣除的范围　可享受加计扣除的税收优惠。 2.免税的权益性投资收益 　　符合条件的居民企业之间的股息、红利等权益性投资是指居民企业直接投同于其他　居民企业取得的投资收益（间接投资、委托代持都不行）。 　　不包括连续持有居民企业公开发行并上市流通的股票不足12个月取得的投资收益（满12个月后可再办退税）。 不属于税法规定的免税股息、红利： ⑴合伙企业从被投资企业取得股息、红利后将其分配组法人合伙人，法人合伙人不得作为免税的股息、红利。 ⑵从境外被投资企业取得的股息、红利。 ⑶收回投资时，投资收回额大于初始投资成本和投资后新增留存收益中权属于企业的份额部分。 　　例：投资额100万元，收回投资时150万元，在投资后新增留存收益中按投资比例权属于企业的份额部分为30万元。 则：150万－100万－30万＝20万（元） 应做为财产转让所得征税。 ⑷撤回或减少投资时，投资收回额大于初始投资成本和投资后新增留　存收益中权属于企业的份额部分。 ⑸转让股权时，投资后被投资企业新增留　存收益中权属于企业的份额。 释：依前例，150－100＝50（万元）征税留存收益中权属于企业的30万元未分配利润不属于免税范畴。 ⑹被投资企业用预计利润分配的股息红利 ⑺超出被投资企业留存收益而分配的股息、红利。 ⑻合作或合资开发房地产项目的，合作方或合资方从开发企业取得未缴纳企业所得税的营业利润。 (二)扣除项目 1．工资与职工福利费用的税前扣除 国税函［2009］3号文“关于企业工资薪金及职工福利费扣除问题的通知”，明确了合理性工资薪金的确认原则。强调按实际发放数税前扣除。 国家税务总局公告2012年第15号明确： 企业因雇用季节工、临时工、实习生、返聘离退休人员以及接受外