分子进化资料讲解.ppt

* 分子钟提供了在分子水平分析系统进化的手段： 例子1：费奇（Fitch）和马戈利来希（Margoriash）使用细胞色素C的氨基酸序列，再现了动植物和菌类的进化历程。 例子2：沙里奇（Sarih）和威尔逊（Wilson）用分子钟研究灵长类进化，否定了拉玛古猿是人类直接祖先，表明了人类的出现比原先人们一直相信的年代晚得多。 * 利用分子钟绘制系统树比依据化石方法有如下优点： 第一，只要比较“现存”生物基因或蛋白质的氨基酸排列顺序即可绘出系统树，仅仅在确定分子钟的走速、量度时间才需要化石资料。 第二，与收集化石相比，工作要简单得多。特别是近来已能轻而易举地确定基因的碱基排列顺序，这一优点就更为突出。 第三，客观而且定量，具有再现性。 * 必须注意：分子进化速度的恒定性是在整个漫长的进化过程后平均得出的结论。 就一种蛋白质来讲，在整个进化过程中，进化速度大体恒定；但是不同的蛋白质的种类，速度就会由于作用于各种蛋白质的机能性制约，差异程度大不相同。 例如，在属于进化最快一类的纤维蛋白肽与进化非常缓慢的组蛋白之间，速度上就有两位数的差异。 * 一般情况下，蛋白质进化缓慢，因而适于研究远缘种间的系统关系，而DNA的分子钟速度快，适宜分析近缘种间的进化。 DNA分子钟研究速度均一，不因基因而异，所以只要知道平均值就可以适用于任何基因；另外还可以叠合由不同基因获得的结果。因此，为了绘出正确的生物进化系统树，还需要在大量数据的基础上进行考察。 * 建立分子钟的步骤 ⑴ 选择所要比较的生物大分子种类：根据具体的研究目的和已掌握的资料，选择进化速率相对恒定、速率大小合适、在要比较的所有物种中都存在的生物大分子。 ⑵ 选择所要比较的物种，确定各个比较组合及其所代表的进化事件。 ⑶ 获得要比较的物种的生物大分子一级结构信息；从古生物学和地质年代学资料中获得每一个比较组合所代表的进化事件发生的地质时间的数据。 ⑷ 以大分子一级结构的差异量为纵坐标，以地质时间为横坐标，将上述各个比较组合的大分子差异量和所代表的进化事件发生时间对应地标在坐标中，并通过统计学分析方法建立一条相关的曲线（或直线），这就是大分子进化速率曲线（或直线）。 ⑸ 利用大分子进化速率曲线，可以推断未知的进化事件发生的大致时间。 * 六、分子系统学 分子系统学是研究生物大分子进化历史的科学，也是研究物种演化历史的科学。 通过比较序列间差异来模拟物种的系统发生是分子系统学（Molecular Phylogenetic Evolution）的主要研究内容。 * （一）分子系统树的构建方法 （1） 获得生物大分子的差异数据 （2） 比较各物种之间同源大分子的差异 （3） 选择合适的算法利用软件构建分子系统树 * ——注意： 构建分子系统树时，既要选择适宜的不同种类的生物，也要选择不同类型的生物大分子。 PCR技术的出现和广泛使用为分子系统学的研究提供了变利条件。近年来测序技术的发展使分子系统学的研究突飞猛进。 * 六、古分子系统与古分子生物学 （一）古分子系统学 古分子系统学是对古生物大分子进行系统研究的科学，涉及古蛋白质分子和古DNA的研究。 （1）古蛋白质的研究 （2）古DNA的研究 * （二）古分子生物学（molecular paleontology） 古分子生物学是一个新兴的学术方向，它借鉴现代分子生物学、生物化学、和有机化学的试验手段，融合了地质学、古生物学、分子进化与分子系统学、有机地球化学等多个学科分支的理论与方法，是一个典型的跨学科研究领域。 * 分子古生物学的两大任务： （一）发掘和分析残留在古生物中的残遗分子。它们通常保存在化石或者沉积底层之中，包括维管植物的木质素、类脂化合物、碳水化合物、氨基酸、DNA等。 （二）综合古生物地层学资料和现代分子生物学数据（DNA和蛋白质），以探讨历史生物界的发生与演化规律。 * 生物标记化合物（molecular marker compound） 生物标记化合物又称为生物标记物、化学化石、分子化石、地球化学化石、指纹化石，或者简称生标（biomarker）。 它是保存在古生物化石或者沉积物中的，源于生物体的一系列有机分子。 * 生物标记物研究的主要意义在于从分子水平上追溯生物体死亡埋葬后有机分子的踪迹并阐明它们的意义。 例1：德国科学家（Alfred Treibs）从页岩、沥青、石油中发现了具有四吡咯结构的石油卟啉，认为它来自古代植物的叶绿素a。 人有了知识，就会具备各种分析能力， 明辨是非的能力。 所以我们要勤恳读书，广泛阅读， 古人说“书中自有黄金屋。 ”通过阅读科技书籍，我们能丰富知识， 培养逻辑思维能力； 通过阅读文学作品，我们能提高文学鉴赏水平， 培养文学情趣； 通过阅读报刊，我们能增长见识