分子力学和分子动力学的模型、算法和应用 总结 与 讨论 学习目标 了解计算化学的主要方法和基本概念 能够读懂相关领域的文献,了解常见分子模拟软件及使用 掌握基本的计算化学研究思路和方法。 了解分子模拟能干什么,我们可以作那些工作,作到什么精度,为在自己的研究领域开展分子模拟方面的研究打一个基础。 分子模拟的双重性质 系综 系综(ensemble)代表一大群相类似的体系的集合。对一类相同性质的体系,其微观状态(比如每个粒子的位置和速度)仍然可以大不相同。(实际上,对于一个宏观体系,所有可能的微观状态数是天文数字。) 统计物理的一个基本假设(各态历经假设)是:对于一个处于平衡的体系,物理量的时间平均,等于对对应系综里所有体系进行平均的结果。 体系的平衡态的物理性质可以对不同的微观状态求和来得到。系综的概念是由约西亚·威拉德·吉布斯(J. Willard Gibbs)在1878年提出的。 常用系综 微正则系综 (microcanonical ensemble) 正则系综 (canonical ensemble) 巨正则系综 (grand canonical ensemble) 等温等压系综 (isothermal-isobaric ensemble) 常用系综 微正则系综 (microcanonical ensemble):系综里的每个体系具有相同的能量(通常每个体
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