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绪论 生物化学的的概念： 生物化学（biochemistry）是利用化学的原理与方法去探讨生命的一门科学，它是介于化学、生物学及物理学之间的一门边缘学科。 生物化学的发展简史 糖类 脂质 蛋白质化学 元素组成 C、H、O、N、S及微量元素，N=16% 氨基酸 结构特点： 构成天然蛋白质分子的氨基酸约有20种，除脯氨酸为α-亚氨基酸、甘氨酸不含手性碳原子外，其余氨基酸均为L-α-氨基酸。 氨基酸的名称、代号、结构式。 分类： 根据氨基酸的R基团的极性大小可将氨基酸分为四类；或其它分类。 理化性质： 两性性质；等电点；光吸收；化学性质（茚三酮、酚） 肽键与肽链 肽键(peptidebond) 由一分子氨基酸的α-羧基与另一分子氨基酸的α-氨基经脱水而形成的共价键(-CO-NH-)。 氨基酸分子在参与形成肽键之后，由于脱水而结构不完整，称为氨基酸残基。 每条多肽链都有两端：即自由氨基端(N端)与自由羧基端(C端)，一般表示肽链时的方向是N端→C端。 肽键平面： 肽键具有部分双键的性质，不能自由旋转；组成肽键的四个原子及其相邻的两个α碳原子处在同一个平面上，为刚性结构，称为肽键平面。 重要的肽 谷胱甘肽、脑啡肽 蛋白质的分子结构 蛋白质的分子结构可人为分为一级、二级、三级和四级结构等层次。一级结构为一维结构，二、三、四级结构为三维结构。 一级结构： 指所有的共价键，包括多肽链中氨基酸的排列顺序，其维系键是肽键；还有二硫键。蛋白质的一级结构决定其空间结构。 蛋白质序列测定基本过程 二级结构： 指多肽链主链骨架盘绕折叠而形成的构象，借氢键维系。主要有以下几种类型： α-螺旋 其结构特征为： 主链骨架围绕中心轴盘绕形成右手螺旋； 螺旋每上升一圈是3.6个氨基酸残基，螺距为0.54nm；③相邻螺旋圈之间形成许多氢键； 侧链基团位于螺旋的外侧。 影响α-螺旋形成的因素主要是： 存在侧链基团较大的氨基酸残基； 连续存在带相同电荷的氨基酸残基； 存在脯氨酸残基。 β-折叠 其结构特征为： 若干条肽链或肽段平行或反平行排列成片； 所有肽键的C=O和N—H形成链间氢键； 侧链基团分别交替位于片层的上、下方。 β-转角 多肽链180°回折部分，通常由四个氨基酸残基构成，借1、4残基之间形成氢键维系。 无规卷曲： 主链骨架无规律盘绕的部分。 三级结构： 指多肽链所有原子的空间排布。 其维系键主要是非共价键（次级键）：氢键、疏水键、范德华力、离子键等， 二硫键对三级结构有重要作用。 四级结构 指亚基之间的立体排布、接触部位的布局等。 其维系键为非共价键。 亚基是指参与构成蛋白质四级结构的而又具有独立三级结构的多肽链。 维持高级结构的力 氢键；范德华力；疏水相互作用；共价交联；离子相互作用。 最重要的是氢键 蛋白质的结构与功能 一级结构决定其空间结构？ 正确的高级结构形成需要其他因素的帮助 高级结构决定功能。 蛋白质的理化性质 两性解离与等电点 蛋白质分子中仍然存在游离的氨基和游离的羧基，因此蛋白质与氨基酸一样具有两性解离的性质。蛋白质分子所带正、负电荷相等时溶液的pH值称为蛋白质的等电点。 蛋白质的胶体性质 蛋白质具有亲水溶胶的性质。蛋白质分子表面的水化膜和表面电荷是稳定蛋白质亲水溶胶的两个重要因素。 沉淀： 非变性沉淀 盐析、有机溶剂 变性沉淀 重金属、生物碱试剂、加热 蛋白质的紫外吸收： 蛋白质分子中的色氨酸、酪氨酸和苯丙氨酸残基对紫外光有吸收，以色氨酸吸收最强，最大吸收峰为280nm。 蛋白质的变性 蛋白质在某些理化因素的作用下，其特定的空间结构被破坏而导致其理化性质改变及生物活性丧失，这种现象称为蛋白质的变性。引起蛋白质变性的因素有：高温、高压、电离辐射、超声波、紫外线及有机溶剂、重金属盐、强酸强碱等。绝大多数蛋白质分子的变性是不可逆的。 蛋白质的分离、纯化与鉴定 一般原则 增加纯度，保持活性 保持低温、避免过酸、过碱以及剧烈的搅拌 蛋白质的抽提原理及方法 溶解性、活性保护 蛋白质分离与纯化的主要方法 电泳、层析和离心 蛋白质的定量方法 紫外、定氮法、酚、G250 核酸的结构与功能 核酸的种类、分布与化学组成 核酸的种类与分布 DNA 线性双链分子（真核细胞核内、病毒）、 环状双链分子（原核细胞、线粒体等）、 单链分子（病毒） DNA的基本功能是作为遗传信息的载体，存在于细胞核（98%），线粒体、叶绿体；或类核、质粒。 RNA 双链分子（病毒）、 单链分子（病毒、细胞）， 细胞中的RNA（单链）又分为三种: tRNA(10-15%)、mRNA(5%)、rRNA(80%)。 90%在细胞质，少量在细胞核。 核酶：具有自身催化作用的RNA称为核酶（ribozyme），核酶通常具有特殊的分子结构，如锤头结构。 化学组成 元素组成 C、H、O、N、P；P=9