谷子和玉米基因组多倍化进化比较分析.pdfVIP

河南农业科学， ， （）： ２０１４４３ ６ １０１５ 　 － ＪｏｕｒｎａｌｏｆＨｅｎａｎＡ ｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＳｃｉｅｎｃｅｓ 　 　 　 　 ｇ 　 谷子和玉米基因组多倍化进化比较分析 ＊ ， ， ， ， ， 张 琼 王振怡 马雪莲 聂林曼 汪厚龙 王金朋 　 （ ， ） 河北联合大学生命科学学院基因组学与计算生物学研究中心 河北唐山 ０６３００９ ： ， ， 摘要 以谷子和玉米为研究对象 基于比较基因组学 利用改进的基因同源共线性方法对其基因组 ， 。 结构和基因同源信息进行比对分析 确定了物种基因组加倍的规模和加倍后的进化规律 结果表 ： （ ）、 （ ） ， 明 谷子中有 对 玉米中有 对 由多倍化产生的重复基因 它们之间的 ３８４６ １０．９％ ６０１６ １８．５％ 　 　 ； ， 直系同源基因对为 对 通过同源共线基因间的同义核苷酸置换率分析证实 玉米与谷子不 １３６５２ 　 ， 仅共同经历了一次古老的全基因组加倍 而且在约 个百万年前玉米独立发生了一次较近的全基 １２ ； ； ， 因组加倍 加倍后产生的大量重复基因片段常分布在染色体末端 基因组进化分析发现 玉米基因 组进化速率比谷子快 ／ 。 １１４ ： ； ； ； ； 关键词 谷子 玉米 多倍化 重复基因 基因共线性 中图分类号： 文献标志码： 文章编号： （ ） Ｓ５１３ Ｓ５１５ Ａ １００４３２６８２０１４０６００１００６ 　 　　 　　 － － － Ｃｏｍ ａｒａｔｉｖｅＡｎａｌ ｓｉｓｏｆＰａｌｅｏ ｏｌ ｌｏｉｄ Ｅｖｏｌｕｔｉｏｎ ｐ 　 ｙ 　 　 ｐ ｙｐ ｙ 　 ｉｎＧｅｎｏｍｅｓｏｆＳｅｔａｒｉａｉｔａｌｉｃａ ａｎｄＺｅａｍａ ｓ 　 　 　 　 　 ｙ