玉米1,3,4-三磷酸肌醇56激酶ITPK家族基因的鉴定和分析.pdfVIP

科技导报2015，33（16） 玉米玉米11,,33,,44--三磷酸肌醇三磷酸肌醇55//66激酶激酶ITPKITPK 家族基因的鉴定和分析家族基因的鉴定和分析 张中保，李向龙，吴忠义，魏建华 北京市农林科学院生物中心；北京市农业基因资源与生物技术重点实验室，北京 100097 摘要摘要 1,3,4-三磷酸肌醇5/6-激酶（ITPK）是一种在动物、植物、线虫中都比较保守的多功能酶，在生物信号传导及生长发育中起 重要作用。为了充分研究玉米中ITPK家族基因系统分析、全生育期基因表达模式及逆境胁迫表达模式，利用玉米基因组数据 库，通过生物信息学手段，鉴定玉米ITPK家族基因的全序列、定位和编码蛋白，通过序列比对进行进化和分类分析。利用玉米高 通量芯片表达数据进行组织表达差异性、干旱胁迫和病害胁迫表达谱分析。结果表明，玉米基因组中含有6个ITPK家族基因， 分布于玉米的4条染色体上。MEME保守结构域分析显示，ZmITPK1-5均含有3个保守的ATP-grasp-4结构域，ZmITPK6含 有两个ATP-grasp-4保守结构域。进化树分析表明ZmITPK可分为3个亚家族。各个发育阶段中，多数成员在生殖器官或营养 器官中均有较高的表达量，只有ZmITPK1在所有器官中表达量都不高。ZmITPK2和ZmITPK3基因受干旱胁迫处理诱导不同 程度上调表达。而在生物胁迫条件下均无显著上调或下调表达。 关键词关键词 玉米；三磷酸肌醇5/6激酶；保守结构域；表达模式 中图分类号中图分类号 S513 文献标志码文献标志码 A doidoi 10.3981/j.issn.1000-7857.2015.16.006 Genome-wideanalysisandidentificationofinositol 1,3,4-trisphosphate 5/6-kinasegenefamilyinmaize(ZeaMays.L.) ZHANGZhongbao,LIXianglong,WUZhongyi,WEIJianhua BeijingAgro-BiotechnologyResearchCenter,BeijingAcademyofAgricultureandForestrySciences;BeijingKeyLaboratory ofAgriculturalGeneticResourcesandBiotechnology,Beijing 100097,China AbstractAbstract On the basis of maize genome database and bioinformatics method, we obtained maize ITPK family genes and their positionsonchromosomeandduplicationinformation.ITPKproteinswereclassifiedaccordingtotheirphylogeneticrelationship.A totalof 6 ZmITPK genesweresystematicallyidentifiedfrommaizeandlocatedon 4 chromosomes.Multiplealignmentandmotif displayresultsindicatedthatallZmITPKproteinssharetwoorthreeconservedATP-grasp-4 domains.Phylogeneticanalysisrevealed thatthe ZmITPK familycouldbedividedintothreegroups.Microarraydatashowedthatthe ZmITPK geneshadtissue-specific expressionpatternsinvariousmaizedevelopmentalstagesandinresponsetobioticandabioticstresses.Theresultsindicatedthat ZmITPK2 and 3 wereinducedbydroughtstressinthemaizeinbredlinesHan21 andYe478.While,allof ZmTIFY geneswerenot inducedbythreepathoge