千里光β-微管蛋白基因结构与功能的生物信息学分析.pdfVIP

植物科学学报　 ２０１４ꎬ３２(５):４８７~４９２ Ｐｌａｎｔ ＳｃｉｅｎｃｅＪｏｕｒｎａｌ － 　 　 ＤＯＩ:１０１１９１３/ ＰＳＪ２０９５ ０８３７２０１４５０４８７ 千里光 β￣微管蛋白基因结构与功能的生物信息学分析 １∗ １∗ １ ２ ２ １∗∗ 张林 ꎬ 徐德林 ꎬ 储士润 ꎬ 吴贵英 ꎬ 沈访 ꎬ 钱 刚 (１.遵义医学院细胞生物学与遗传学教研室ꎬ 贵州遵义 ５６３０００ꎻ ２.遵义医学院第一临床学院ꎬ 贵州遵义 ５６３０００) 摘　 要:β￣微管蛋白是影响细胞新陈代谢和行使功能的重要结构物质ꎬ 研究β￣微管蛋白基因的序列信息对揭示其 蛋白结构与功能具有重要指导意义ꎮ 从千里光全长ｃＤＮＡ文库中分离得到β￣微管蛋白基因ꎬ 并采用生物信息学 软件进行序列分析ꎮ 结果显示ꎬ 该基因长度为１７５０ ｂｐꎬ 编码的蛋白质长度为４４８个氨基酸ꎬ 与柚子β￣微管蛋 白的同源性最高ꎬ 达９６％ꎻ 其蛋白质分子量为５００１ｋＤꎬ 理论等电点为４８３ꎮ β￣微管蛋白二级结构主要组成为 无规则卷曲结构和α螺旋结构ꎻ 结构域分析发现该蛋白具有两个保守结构域ꎻ 三级结构预测为相对稳固的类球 形结构ꎻ 信号肽分析将该蛋白主要定位于细胞质、 过氧化物酶体、 线粒体基质等亚细胞器位置ꎮ 将该基因序列 上传至ＧｅｎＢａｎｋ所获得的登录号为ＫＦ８８７４９５ꎮ 本实验结果为千里光β￣微管蛋白的作用机制揭示和应用研究提 供了基础数据ꎬ 也为植物β￣微管蛋白基因的分子研究提供了理论依据及基础资料ꎮ 关键词:千里光ꎻβ￣微管蛋白ꎻ结构与功能ꎻ 生物信息学 中图分类号:Ｑ７５　 　 　 　 　 文献标识码:Ａ　 　 　 　 　 文章编号:２０９５￣０８３７(２０１４)０５￣０４８７￣０６ Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃ Ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ Ｔｕｂｕｌｉｎ￣ｂｅｔａ Ｇｅｎｅ ｉｎ Ｓｅｎｅｃｉｏｓｃａｎｄｅｎｓ Ｂｕｃｈ. ￣Ｈａｍ. ｅｘ Ｄ. Ｄｏｎ １∗ １∗ １ ２ ２ １∗∗ ＺＨＡＮＧ Ｌｉｎ ꎬＸＵ Ｄｅ￣Ｌｉｎ ꎬＣＨＵＳｈｉ￣Ｒｕｎ ꎬＷＵ Ｇｕｉ￣Ｙｉｎｇ ꎬＳＨＥＮ Ｆａｎｇ ꎬＱＩＡＮ Ｇａｎｇ (１. Ｄｅｐａｒｔｍｅｎｔ ｏｆ Ｃｅｌｌ Ｂｉｏｌｏｇｙ ａｎｄ ＧｅｎｅｔｉｃｓꎬＺｕｎｙｉ Ｍｅｄｉｃａｌ ＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬＺｕｎｙｉꎬＧｕｉｚｈｏｕ５６３０００ꎬＣｈｉｎａꎻ ２. Ｔｈｅ Ｆｉｒｓｔ Ｃｌｉｎｉｃａｌ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ ｏｆＺｕｎｙｉ Ｍｅｄｉｃａｌ ＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬＺｕｎｙｉꎬＧｕｉｚｈｏｕ５６３０００ꎬＣｈｉｎａ) Ａｂｓｔｒａｃｔ:Ｂｅｔａ￣ｔｕｂｕｌｉｎｉｓａｎｅｓｓｅｎｔｉａｌｃｏｍｐｏｎｅｎｔ ｉｎｃｅｌｌｍｅｔａｂｏｌｉｓｍａｎｄｆｕｎｃｔｉｏｎｉｍｐｌｅｍｅｎｔａｔｉｏｎ. Ｉｎｔｈｉｓ ａｒｔｉｃｌｅꎬｔｈｅ Ｓｅｎｅｃｉｏｓｃａｎｄｅｎｓ Ｂｕｃｈ.￣Ｈａｍ.ｅｘ Ｄ. Ｄｏｎ ｂｅｔａ￣ｔｕｂｕｌｉｎｇｅｎｅ ｓｅｑｕｅｎｃｅｗａｓ ａｎａｌｙｚｅｄ ｆｏｒ ｉｔｓ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ ａｎｄ ｆｕｎｃｔｉｏｎꎬ ａｓ ｗｅｌｌ ａｓ ｔｈｅ ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐ ｂｅｔｗｅｅｎ ｔｈｅｍꎬ ｔｈｒｏｕｇｈ ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ.Ｔｈｅ ｂｅｔａ￣ｔｕｂｕｌｉｎｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓｅｑｕｅｎｃｅｗａｓｏｂｔａｉｎｅｄｆｒｏｍａｆｏｒｍｅｒｌｙ ｃｏｎｓｔｒｕｃｔｅｄ ｆｕｌｌ￣ｌｅｎｇｔｈ ｃＤＮＡ ｌｉｂｒａｒｙ ｏｆ Ｓ. ｓｃａｎｄｅｎｓꎬ ａｎｄ ｗａｓ ｕｓｅｄ ａｓ ｔｈｅ ｑｕｅｒｙ ｆｏｒ ａ ｓｅｒｉｅｓ ｏｆ ｏｎｌｉｎｅ ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ ｔｏｏｌｓ.Ｔｈｅ Ｓ. ｓｃａｎｄｅｎｓ ｂｅ