环境DNA的研究技术及在生态学领域的应用.pdfVIP

生物技术通报 ·技术与方法· BIOTECHNOLOGY BULLETIN 年第 期 2014 10 环境 DNA 研究技术及其在生态学领域的应用 徐浩  罗茜  李云  薛洋  叶勤 （西南大学动物科技学院 淡水鱼类资源与生殖发育教育部重点实验室，重庆 400716） 摘 要 ： 环境DNA（environmental DNA，eDNA）是指从环境样本中提取的所有DNA 的集合，包括环境微生物以及从生物 体上脱落下来的活细胞DNA 和因生物死亡后细胞破碎而游离出的胞外DNA。按照宏基因组学概念，eDNA 研究技术主要是指直接 从环境样本中提取基因组DNA 后进行测序分析的方法。较传统的研究方法，eDNA 应用最大的优势在于更有效地解决了特定环境 样本中宏量生物的分类问题，利于更进一步研究生态学问题，该技术耗时短、成本低，准确度高。第二代高通量测序技术的开发 成功，进一步拓展了eDNA 的应用范围，并开始从微生物学向动、植物学领域拓展，促进了传统生态学领域在研究方法和思想上 的一场革新。对eDNA 的研究技术在生物多样性分析、动物食性分析、生物量估测等生态学领域的应用进行了综述，最后对eDNA 研究技术的发展趋势和前景作出展望。 关键词 ： 环境DNA 宏基因组学 生态学 物种分类 Applications of Environmental DNA Approaches to Ecological Researches Xu Hao Luo Xi Li Yun Xue Yang Ye Qin （ （ ）， ， Key Laboratory of Freshwater Fish Reproduction and Development Ministry of Education College of Animal Science and Technology Southwest University ，Chongqing 400716 ） Abstract: Environmental DNA（eDNA）refers to DNA that can be extracted from environmental samples, without first isolating any target organisms, which includes DNA of environmental microorganisms, alive cellular fallen off from organisms, and extracellular DNA resulting from natural death organisms and subsequent destruction of cell structure. According to metagenomics concept, eDNA technologies mainly refers to the methods of sequencing analysis with genomic DNA from environmental samples. Comparing with the traditional way, the significant advantage of eDNA technologies is more efficient in solving the classification problem of mass organisms in given