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热带海洋学报 JOURNAL OF TROPICAL OCEANOGRAPHY 2010 年 第 29 卷 第 3 期：55−60
海洋生物学 ;
34 16S-23S rDNA DGGE
苏婷, 罗鹏, 胡超群, 任春华
(, 510301)
: PCR-(PCR-DGGE) 34
16S-23S rDNA (Intergenic Spacer Region, ISR), 34
ISR PCR-DGGE 4―10 , 15 HIJK
, A18 A25, 0.4ISR PCR-DGGE
: ; 16S-23S rDNA ; PCR-DGGE
中图分类号: S182 文献标识码: A 文章编号: 1009-5470(2010)03-0055-06
Analysis of the polymorphism of 16S-23S rDNA intergenic spacer regions from 34
Vibrio parahaemolyticus strains by denaturing gradient gel electrophoresis
SU Ting, LUO Peng, HU Chao-qun, REN Chun-hua
(South China Sea Institute of Oceanology, Key Laboratory of Marine Bio-resources Sustainable Utilization , cas, Key Laboratory of
Applied Marine Biology of Guangdong , Guangzhou 510301)
Abstract: Using PCR-denaturing gradient gel electrophoresis (PCR-DGGE), the polymorphism of 16S-23S rDNA intergenic
spacer regions (ISR) from 34 Vibrio parahaemolyticus strains, including type strains and those isolated from environment and
aquatic animals, were analyzed. The phylogenic relationships of these strains were also analyzed. The results showed that the
ISRs could be separated into 4−10 different bands through PCR-DGGE. Thirty-four V. parahaemolyticus strains shared 15
polymorphic sites. Using MVSP, 34 strains were clustered into four groups, H, I, J, and K. Strains A18 and A25 had farthest
genetic distance, with a value of 0.4. The present study suggested that ISR PCR-DGGE provided a new method for genotyping
of V. parahaemolyticus.
Key words: Vibrio parahaemolyticus; 16S-23S rDNA intergenic spacer Regions; PCR-DGGE
Vibrio parahaemolyticus ,
, ,
[1], ,
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