甘蓝型油菜基因组中开花期QTL的检测和分析.pdf

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摘要 摘 要 开花是高等植物由营养生长向生殖生长转变的标志之一,决定着植物的有性生 殖。适时开花以避开不利外界环境,是植物得以繁衍的前提,也是决定作物能否获 得丰收的优良农艺性状。植物的开花是由多基因所控制的各种生理生化代谢途径所 决定的,是复杂的数量性状,同时也受各种外界环境因素的调节,其中温度和光照 是关键的环境因子。油菜是重要的油料作物,根据开花是否需要低温春化,分为冬 油菜和春油菜两种类型。人们对油菜开花的机制知之甚少,对决定油菜冬、春性分 化的机制更不得而知。 本实验室以这两个品种为亲本构建了TNDH群体并在9个冬油菜环境下种植了该群 DH群 体。实验室还在TNDH群体基础上衍生了RC.F2群体。本论文报告了用TN 体做的两年春油菜开花试验,分析整理了DH群体和RC.F2群体多年多点共13个冬 的高密度TN遗传连锁图;利用高密度图谱上229个有DNA序列信息的标记与拟南 silico 芥基因组进行了电子比对作图(in 进行油菜开花期Q11L及互作位点的检测和遗传效应分析,目的是在基因组水平上构 建甘蓝型油菜开花性状的基因网络图。 研究结果表明,在所有冬油菜环境中群体植株的开花期均表现超亲分离,证实 TN DN群体的开花期为数量性状。为了充分揭示数量性状的多基因特征,本文不仅 综合分析了两个群体13个冬、春油菜环境中在显著水平上(P=O.05)检测出的开 level Q凡SL厂QTL),还将效应较小、显 花期QTL(称为显著水平QTL,significant 连锁群上的一个QTL簇对冬油菜环境开花早晚有决定性作用。仅有1个QTL能在 春油菜环境条件下检测到,为春油菜环境特异QTL。另外还检测到了63个互作对。 通过电子比对,将拟南芥120个开花基因的548个同源基因定位到TN遗传图谱上, 发现其中27%和9%的同源基因被分别定位到油菜丌花期arL置信区间和互作位点 的标记区间,它们在很大程度上代表着油菜相应区『白J的丌花功能基因。由此,一个 甘蓝型油菜基因组中开花期QTL检测和分析 由上百个QTL、互作位点和区间功能基因构成的甘蓝型油菜开花调控网络图初步形 成。它不仅为进一步研究油菜开花性状提供了坚实的基础,同时为其它复杂农艺性 状的解析拓宽了研究思路。 为了进一步检验QTL定位的准确性和电子比对定位功能基因的可靠性,也为了 为油菜的遗传改良提供重要的基因资源,本文对TNDH群体中表现春油菜环境特异 它在缺乏春化的环境条件下解释群体开花期变异(方差)的52%,而在越冬的冬油 菜条件下对群体植株开花期表型变化无贡献。前人在拟南芥中已经揭示了开花的春 化途径,而本试验开展的比较基因组学分析表明,春化途径中的关键抑制基因FLC 在拟南芥基因组中所处的位置,正对应于口_聊俨4的置信区间。 以TN DH群体的 DH群体两亲本之一Tapidor中FLC的同源序列为探针与TN 图谱上,正位于口聊口一4置信区间的峰值处,于是将该区间的同源FLC基因命名为 一个内含子中存在着三处碱基的差异。根据其中两个差异位点设计等位基因特异性 标基因构建的BC3F2群体,在春油菜环境下进行开花期表型和基因型的分析。卡方 测验表明开花期表型分离符合3:1的分离比(晚花或不开花:早花),同时基因型与表 型共分离,表明BnFLCIO为春油菜环境中控制TNDH群体开花早晚的主效基因。 其它冬油菜品种的表达量最高。对73个不同来源的油菜品种资源进行BnFLCIO与 油菜冬春性关联分析,结果M2扩增位点的多态性与开花早晚所表现的冬春性表型 为控制油菜品种冬、春性分化的关键基因。 本论文提出了三个进一步研究课题:1.微效真实QTL的证实及QTL检测体系 的改进;2.油菜冬、春性分化关键基因BnFLCIO决定油菜种性的分子机理;3.冬 油菜环境特异开花期QTL簇的解析。 关键词:甘蓝型

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