基因组学第10章要点.ppt

第10章 基因组表观遗传 1) 什么是表观遗传 2) 表观遗传现象 3) 表观遗传机制 位置效应 副突变 甲基化 基因组印记 染色质重建 剂量补偿 表观遗传学的例子 1) 细胞的分化是一种典型 的表观遗传学现象, 如人 类眼睛细胞和肌肉细胞含 有相同的基因组, 但基因 的表达差异很大. 2) while a mutation in the axin gene called axin- fused produces mice with kinky tails (弯曲尾巴), the degree of kinkiness varies among genetically identical littermates (同一窝老鼠)(Figure). Epigenetics的历史 1) 上世纪40年代, Waddington首创“epigenetics” 一词, 用以概括研究基因及其产物如何转变为表现型的领域. 用现在的话说, 就是遗传信息如何转变为表型的过程. 2) 就词义而言, “epi”是“其上” (upon) 或“超越” (over)的意思. 因此, 在epigenetics的定义中, genetics只涉及基因的结构层次, 而epigenetics则涉及基因如何发挥其功能以及基因之间的互作关系. 3) 在Waddington的“epigenetics”定义中, epigenetics的位置处于遗传学, 发育和生态学的交叉口. 表观遗传的通俗解释 我国古代有“橘生淮南则为橘，生于淮北则为枳，叶徒相似，其实味不同”的记载，说明相同基因型的生物在不同的环境条件下表型有很大的差别。同一种中药材在不同产地生长，其药效相差甚远，这也是环境影响基因表达的突出例子。这种因环境影响而改变的基因表达模式并不涉及基因型的变异，但可以重复出现，稳定遗传，是一种典型的表观遗传现象。 同卵孪生子的表型趋异也是一种表观遗传. 最近的研究发现, 随着年龄的增长同卵孪生子的表型差异有扩大的趋势. Epigenetics概念的变迁 1) 1982年“Dictionary of Biology”的定义: epigenetics系指遗传因子与发育过程之间的互作, 通过这种互作使基因型转变为表型. 2) 1992年, Hall在其所著的“Evolutionary Developmental Biology”一书中, 将epigenetics定义为: 在发育过程中遗传因子和非遗传因子作用于细胞, 选择性控制基因的表达, 并逐步增加表型复杂性的过程. 3) 1996年, 在“Epigentic Mechanisms of Gene Regulation”一书中将epigenetics定义为: 不涉及DNA顺序的改变而发生的基因功能的差异, 这种差异能通过有丝分裂和减数分裂稳定传递. 4) 2001年Science杂志对epigenetics的定义为: 不涉及DNA顺序的变异但能通过有丝分裂和减数分裂遗传的基因表达模式的改变. 表观遗传学 表观遗传学(epigenetics): 研究在不改变DNA顺序的情况下基因表达 出现可遗传变化的分支学科. 这种表达模式 的改变可通过有丝分裂和减数分裂传递给 子代细胞或个体. 表观遗传学是功能基因组 学研究的重要领域. 表观遗传是基因组程序化的一种表现形式. 表观遗传学的内容 广义的表观遗传(epigenetic) 包括以下内容: 1) DNA的甲基化 2) 位置效应 3) 核小体和组蛋白的修饰 (乙酰基化和甲基化) 4) RNAi (siRNA和miRNA)导致的基因沉默 5) 染色质重建 (如X-染色体的失活) 6) 免疫组织细胞DNA的重排 7) 基因组印记(genomic imprinting) 8) 等位基因的副突变及同源抑制，颠换效应 9) 朊蛋白 (Prion) 欧洲已启动epigonome计划 In October 2000, the Human Epigenome Consortium (the Sanger Institute, Epigenomics AG