第3核酸的结构与功能.ppt

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+ + Py Py Py Py Py Py Pu Pu P P P P P P P P P P 2H2O (2)RNase (1)牛胰核糖核酸酶(RNase Ⅰ) 作用:嘧啶核苷3’-磷酸与其它核苷酸连键 专一性极高的内切酶 产物: 3’嘧啶核苷酸/其结尾的寡核苷酸 P P P P P P P 2H2O P P + + OH OH P P P P P G A G A A A G G C U U C (2)核糖核酸酶T1 (RNase T1) 作用:3’-鸟苷酸与相邻核苷酸5’-OH连键 产物:3’-鸟苷酸或以其为末端的寡核苷酸 (3)核糖核酸酶T2 (RNase T2 ) 作用位点为Ap残基 可将tRNA完全降解为3’-腺苷酸结尾的寡核苷酸 ①DNaseⅠ:牛胰脱氧核糖核酸酶 Mg2+激活、柠檬酸盐抑制 切断双链或单链DNA ——以5’-磷酸为末端的寡聚核苷酸 ② DNase Ⅱ:牛脾脱氧核糖核酸酶 Mg2+抑制 ——3’-磷酸为末端的寡聚核苷酸 (3)DNase ③链球菌脱氧核糖核苷酸酶: 内切酶,作用于DNA 产物为5’-磷酸为末端的碎片 ④限制性内切酶(细菌) 主要降解外源DNA 具严格的碱基序列专一性 EcoRⅠ E:大肠杆菌E.coli属名 co:种名的头两个字母 R:大肠杆菌的菌株 Ⅰ:该细菌中已分离出的这类酶的编号 限制性内切酶通常与甲基化酶成对存在: 具有相同的底物专一性,识别相同碱基序列。 甲基供体:S-腺苷甲硫氨酸 甲基受体:DNA上的A与C ——甲基化使细菌自身的DNA带上标记 5 ’-T-A-G-C-T-A- -T-A-G-C-T-A-3’ 3’-A-T-C-G-A-T- - A-T-C-G-A-T- 5 ’ 5 ’-T-A-G-C-T-A- -T-A-G-C-T-A-3’ 3’-A-T-C-G-A-T- - A-T-C-G-A-T- 5 ’ 非特异性的糖苷酶 碱基特异N-糖苷酶 水解糖苷键 (4)N-糖苷酶 制备天然核酸必需采用温和的条件,防止过酸、过碱,避免剧烈搅拌,尤其重要的是防止核酸酶的作用 一、核酸的分离、纯化及鉴定 第4节 核酸研究方法 真核DNA以核蛋白(DNP)形式存在,DNP溶于水或高盐溶液(1mol/L NaCl),但不溶于低盐溶液(0.14mol/L NaCl),据此,采用高盐提取,低盐沉淀,可将DNP与RNA核蛋白分开,提取出DNP。 去除蛋白质:水饱和酚,氯仿异戊醇。 DNA沉淀:0.3M NaAC-70%乙醇 1、DNA的提取 制备RNA时,最重要的是使RNase灭活: ①所有容器都要经过高温处理,不能高温高压的用0.1%焦碳酸二乙酯(DEPC)处理。 DEPC能使蛋白质乙基化而破坏RNase活性; ②加入强变性剂(如胍盐)使RNase失活; ③在RNA的反应体系内加入RNase的抑制剂(如RNasin) 2、RNA的提取 (2)定糖法 RNA:核糖→ 糠醛→ →绿色物质(670-680nm) DNA:脱氧核糖+二苯胺→兰色物质(595-620nm) 苔黑酚/地衣酚 浓HCl 浓硫酸 (1)紫外分光光度法 1个A~50μg/ml 双链DNA ~40μg/ml RNA或单链DNA 3、核酸含量测定 (3)定磷法 核酸含磷量为9.5% 1g磷相当于10.5g核酸 (4)琼脂糖凝胶电泳 溴乙锭能插入DNA分子的碱基对间形成复合物 在紫外线照射下溴乙锭发橘红色荧光 荧光强度与DNA含量成正比 英国 Sanger 1955 确定牛胰岛素结构,1958 获诺贝尔化学奖 1975 设计出DNA测序法,1980 获诺贝尔化学奖 合成一段与待测DNA序列互补的DNA片段群。 二、核酸的一级结构测定 末端终止法——Sanger 2’,3’双脱氧核苷三磷酸(ddNTP)是DNA合成链延伸的抑制剂。 MOV : MCB4.0\Dideoxy sequencing of DNA DNA序列分析仪: 四色荧光基团标记的dNTP 1.DNA双螺旋结构模型是_________于____年提出的。 2.核酸的基本结构单位是_____。 3.DNA双螺旋的两股链的顺序是______关系。 4.B型DNA双螺旋的螺距为___,每螺旋有___对碱基,每对碱基的转角是___。 5.维持DNA双螺旋结构稳定的主要因素是_____,其次,大量存在于D

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