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第二章 蛋白质
1、凯氏定氮法:蛋白质含量=总含氮量-无机含氮量)×6.25
例如:100%的蛋白质中含N量为16%,则含N量8%的蛋白质含量为50%
100% /xg=16% /1g x=6.25g
2、根据R基的化学结构,可将氨基酸分为脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、杂环氨基酸和杂环亚氨基酸。
按照R基的极性,可分为非极性R基氨基酸、不带电荷的极性R基氨基酸、极性带负电荷的R基氨基酸、极性带正电荷的氨基酸。
类别
氨基酸名称 缩写符号 简写符号
非极性
丙氨酸 Ala A 缬氨酸 Val V 亮氨酸 Leu L 异亮氨酸 Ile I 苯丙氨酸 Phe F 甲硫氨酸(蛋氨酸) Met
M
脯氨酸 Pro P 色氨酸 Trp W
极性不带电荷
甘氨酸 Gly G 丝氨酸 Ser S 苏氨酸 Thr T 天冬酰胺 Asn N 谷氨酰胺 Gln Q 酪氨酸 Tyr Y 半胱氨酸 Cys C 极性带负电荷(酸性氨基酸) 天冬氨酸 Asp D 谷氨酸 Glu E 极性带正电荷(碱性氨基酸) 组氨酸 His H 赖氨酸 Lys K 精氨酸 Arg R 3、氨基酸的重要理化性质
(1)一般物理性质
无色晶体,熔点极高(200℃以上),不同味道;水中溶解度差别较大(极性和非极性),不溶于有机溶剂。氨基酸是两性电解质。
氨基酸等电点的确定:
酸碱确定,根据pK值(该基团在此pH一半解离)计算:
等电点等于两性离子两侧pK值的算术平均数。
化学性质
①与水合茚三酮的反应:Pro产生黄色物质,其它为蓝紫色。在570nm(蓝紫色)或440nm(黄色)定量测定(几μg)。
②与甲醛的反应:氨基酸的甲醛滴定法
③与2,4-二硝基氟苯(DNFB)的反应:形成黄色的DNP-氨基酸,用来鉴定多肽或蛋白质的N端氨基酸,又称Sanger法。或使用5-二甲氨基萘磺酰氯(DNS-Cl,又称丹磺酰氯)也可测定蛋白质N端氨基酸。
④与异硫氰酸苯酯(PITC)的反应:多肽链N端氨基酸的α-氨基也可与PITC反应,生成PTC-蛋白质,用来测定N端的氨基酸。
4、肽的结构
线性肽链,书写时规定N端放在左边,C端放在右边,用连字符将氨基酸的三字符号从N端到C端连接起来,如Ser-Gly-Tyr-Ala-Leu。命名时从N端开始,连续读出氨基酸残基的名称,除C端氨基酸外,其他氨基酸残基的名称均将“酸”改为“酰”,如丝氨酰甘氨酰酪氨酰丙氨酰亮氨酸。若只知道氨基酸的组成而不清楚氨基酸序列时,可将氨基酸组成写在括号中,并以逗号隔开,如(Ala,Cys2,Gly),表明此肽有一个Ala、两个Cys和一个Gly组成,但氨基酸序列不清楚。
由于C-N键有部分双键的性质,不能旋转,使相关的6个原子处于同一个平面,称作肽平面或酰胺平面。
5、、蛋白质的结构
(一)蛋白质的一级结构(化学结构)
一级结构中包含的共价键主要指肽键和二硫键。
(二)蛋白质的二级结构
(1)α-螺旋(如毛发)
结构要点:螺旋的每圈有3.6个氨基酸,螺旋间距离为0.54nm,每个残基沿轴旋转100°。
(2)β-折叠结构(如蚕丝)
(3)β-转角
(4)β-凸起
(5)无规卷曲
(三)蛋白质的三级结构(如肌红蛋白)
(四)蛋白质的司机结构(如血红蛋白)
6、蛋白质分子中氨基酸序列的测定
氨基酸组成的分析:
酸水解:破坏Trp,使Gln变成Glu, Asn变成Asp
碱水解:Trp保持完整,其余氨基酸均受到破坏。
N-末端残基的鉴定:
鉴定N-末端的氨基酸残基常用2,4-二硝基氟苯(DNFB)的反应或丹磺酰氯反应。异硫氰酸苯酯(PITC)反应也可用于鉴定N-末端的氨基酸残基,但主要是用于测定肽段的氨基酸序列。
C-末端残基的鉴定:
肼解法:蛋白质或多肽与无水肼加热发生肼解,反应中只有C端氨基酸以游离形式存在。
还原法:肽链C端氨基酸可用硼化锂还原成相应的α-氨基醇,可用层析法加以鉴别。
羧肽酶法:羧肽酶从羧基端(C端)一个一个切。
多肽链的裂解:
酶切位点或作用特点:
胰蛋白酶:Lys, Arg的C侧
糜蛋白酶(胰凝乳蛋白酶):Phe, Tyr, Trp的C侧
梭菌蛋白酶:Arg的C侧
葡萄球菌蛋白酶:Asp或Glu的C侧
嗜热菌蛋白酶:Leu, Ile, Val的N侧
氨肽酶:从氨基端(N端)一个一个切
溴化氰(CNBr): Met的C端
羟胺:Asp的C侧,Gly的N侧
7、蛋白质的沉淀反应:加高浓度盐类;加有机溶剂;加重金属盐类;加某些酸类;加热。
8、氨基酸的颜色反应
第三章 核酸
1、核苷酸由含氮碱基(嘌呤或嘧啶),戊糖(核糖或脱氧核糖)和磷酸组成。核酸是核苷酸的多聚物,其连接键是3’,5’-磷酸二酯键。
2、生物体内的
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