生物化学中文综述精要.doc

生物化学中文综述 摘要：生物化学式运用化学的理论和方法研究生命物质的边缘学科。其任务主要是了解生物的化学组成、结构及生命过程中各种化学变化。从早期对生物总体组成的研究，进展到对各种组织和细胞成分的精确分析。 关键词：生物化学、细胞生物学、生物分子化学 1.蛋白质的功能和结构 作为一切生命活动的支持者和参与者，蛋白质参与到了生物体的各项生命活动中，作为遗传物质的表达产物，紧跟遗传物质之后介绍体现了二者的紧密关系。 1.1氨基酸 每一个氨基酸都有一个α-羧基和一个一级α-氨基（除了脯氨酸有一个仲胺氨基之外）。 在生理pH时，α-羧基解离，形成带负电荷的羧基盐离子（-COO-），而氨基质子化（-NH3+）。每个氨基酸的α-碳原子上都结合有一种侧链（共20种），这个侧链的化学性质决定了一个氨基酸在蛋白质中的功能 ，也提供氨基酸分类的基础。氨基酸由此分为非极性、无电荷性、酸性和碱性的氨基酸。 所有的游离氨基酸加上肽链中的带电氨基酸都能够产生缓冲作用。一种溶液的pH与一个弱酸（HA）及它的共轭碱浓度之间的关系可以用Henderson-Hasselbalch方程表示。缓冲可发生于pKa±1pH单位的范围内，当pH=pKa即[A-]=[HA]时，缓冲达到最大。每一氨基酸的α-碳原子（除了甘氨酸）都有4个不同的化学基团，所以是一个手性或旋光性的碳原子。在人体合成蛋白质中只有L型的氨基酸。 1.2蛋白质的结构 组成蛋白质的20种氨基酸由肽键相连，在氨基酸线性序列中，含有蛋白质分子形成独特三维结构所需的消息。 蛋白质结构的复杂性通过四个层次来分析，这四个层次称之为一级、二级、三级和四级结构。蛋白质中的氨基酸通过肽键共价结合，肽键是这个氨基酸的α-羧基和另一个氨基酸的α-氨基形成的酰胺键。 蛋白质中氨基酸的序列成为蛋白质的一级结构；多肽链不会随机形成一个三维结构，通常是线性序列中彼此位置相接近的氨基酸形成有规律的排列，这些排列称为多肽的二级结构，常见有α螺旋、β片层和β玩去（β转角）；多肽链的一级结构决定了它的三级结构，“三级”指的是结构域的折叠和结构域在多肽中的最终排列；许多蛋白质是由一条多肽链构成，称之为单体蛋白质，另一些蛋白质是由两条或更多条结构或完全无关的多肽链组成，这些多肽亚基的排列称为蛋白质的四级结构。 蛋白质变性导致蛋白质去折叠和结构无序化，变性并不伴有肽键的水解，变性有时可以逆转，但大多数是不可逆的。 1.3球状蛋白 球状血红素蛋白是一组含有以血红素为紧密结合辅基的特殊蛋白。血红素基团的作用取决于血红素蛋白三维结构造成的环境。例如，细胞色素的血红素基团作为电子携带者，功能随其氧化和还原的状态而变化。相比之下，过氧化氢酶的血红素基团是催化过氧化氢降解的酶的活性部分。在人体两种最丰富的血红素蛋白——血红蛋白和肌红蛋白中，血红素基团的作用是可逆地结合氧。 1.4纤维状蛋白 胶原蛋白和弹性蛋白是常见的、性质明确的、在体内有结构性作用的纤维状细胞外基质蛋白。胶原蛋白分子富含脯氨酸、赖氨酸和甘氨酸，后者出现于一级结构的每一个第三位上。胶原蛋白也含有羟脯氨酸、羟赖氨酸和糖基化的羟赖氨酸，他们是经翻译后修饰形成的。胶原蛋白分子通常形成含有长的、僵硬的、三股螺旋结构的原纤维，三条胶原蛋白多肽链以索样超螺旋相互缠绕（三螺旋）。其他类型胶原蛋白形成网状的网络。弹性蛋白是一种具橡胶养性质的结缔组织蛋白，存在于某些组织（如肺）。α1-抗胰蛋白酶（α1-AT）主要由肝脏产生，也可以由其他组织（如单核细胞和肺泡巨噬细胞）产生，它可防止肺泡壁弹性蛋白的降解。α1-AT的缺陷能引起肺气肿，在某些病例也可导致肝硬化。 1.5酶 酶是通过降低过渡态能量而增加化学反应速率的蛋白质催化剂。在它们所催化的反应中，酶未被消耗。酶催化反应是高效的、具有特异性的。 酶分子含有一个特殊的称之为活性部位的口袋或裂隙。活性部位含有参与底物结合和催化作用的氨基酸侧链。活性部位结合底物，形成酶-底物（ES）复合物。结合引起酶构象的改变（诱导契合），使之可进行催化反应。ES转化为酶-产物（EP）复合物，最终解离为酶和产物。通常情况下，细胞中的酶通过提高低活化自由能的替代反应途径，加速反应进程。酶不能改变反应物或产物的自由能，因而不会改变化学平衡。大多数酶表现为米-曼动力学，以初始反应速率（V0）对底物浓度（[S]）作图，显示为相似于肌红蛋白氧解离曲线的双曲线形。 米-曼方程：米-曼方程表述了反应速率如何随底物浓度而变化。 V0=(Vmax[S])/(Km=[S]) ，其中V0为初始反应速率，Vmax为最大反应速率，Km为米氏常数，[S]为底物浓度。 任何能够减弱酶催化反应速率的底物均称为抑制剂。两种最常见的可逆性抑制类型是竞争性抑制（增加表观Km）和非竞争性抑制（降低表观Vm）。具有竞争性抑制