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;目录;;;;;; 1998年,来自瑞典皇家科学院、斯德哥尔摩大学、英国邱园、康奈儿大学、佛罗里达大学和密苏里植物园等学者,组成了被子植物种系发生组(APG,Angiosperm Phylogeny Group); 被子植物APG III分类法是被子植物种系发生学组(APG)继1998年APG I及2003年APG II之后,花了6年半修定的被子植物分类法,于2009年10月正式在林奈学会植物学报发表。在推出第三版的同时, 又依据系统发育关系对各科作了线性排列。对历史上出现的被子植物科名进行汇总, 厘清了所有这些科名与APG系统科名的正异名对应关系, 并将整个被子植物作为有胚植物(木贼纲Equisetopsida)的一个亚纲处理, 即木兰亚纲, 被子植物各单系分支则设为超目, 其下再设目、科级单元, 增加红毛椴科, 使APG III系统的科数目增加到414科。;;APG III被子植物系统进化关系图;;APG III承认了早前版本的所有45目, 并新接受了14个目,共计59目。新增的目有:无油樟目、睡莲目、金粟兰目、无叶莲目、昆栏树目、黄杨目、智利藤目、葡萄目、蒺藜目、美洲苦木目、十齿花目、南鼠刺目、鳞叶树目及盔瓣花目。; APG III所承认的科共有414个,有许多小型科被合并,早前被建议合并的55科之中有44个被合并。即八角茴香科、葱科、百子莲科、龙舌兰科、星捧月科、西丽草科、风信子科、异蕊草科、假叶树科、紫灯花科、独尾草科、萱草科、独叶草科、荷包牡丹科、蕨叶草科、双颊果科、水青树科、齿蕊科、高柱花科、花茎草科、谷木科、微形草科、马尾树科、水母柱科、羽叶树科、王冠草科、时钟花科、钟萼木科、地果莲木科、弯子木科、骆驼蓬科、旱霸王科、珙桐科、厚皮香科、假红树科、桃叶珊瑚科、陀螺果科、半边莲科、离水花科、黄锦带科、川续断科、北极花科、刺续断科及败酱科等。;此外,APG III也承认了19个新的科。刺藤科、青皮木科、粟麦草科、南商陆科、小鸡草科、土人参科、回欢草科、裂药树科、胡桐科、南线梅科、非杨柳科、十齿花科、醉蝶花科、簇花草科、帽蕊草科、管花木科、母草科及Thomandersiaceae等。(还有首次提到眠树科,但已并入盔瓣花科。)
和APG II相比,APG III被子植物之中许多类群的关系已经获得进一步厘清,地位未定的科从早前的39科大幅减少到10科,即离花科、锁阳科、多须草科、清风藤科、五桠果科、紫草科、二歧草科、茶茱萸科、管花木科及五蕊茶科。这10科中有8科的位置也已经大致确定,只有离花科及锁阳科未有归属。;此外,还有3个属的地位未定,即Gumillea、Nicobariodendron及Petenaea; 其中Nicobariodendron尼科巴缨花属(偏向于卫矛科)及Petenaea枇藤属(偏向锦葵目)是首次在此列出。;;;
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