JMP深度文章_预先诊断,妙手回春_20150916技术分析.docxVIP

预先诊断，妙手回春 先进统计工具提高对致命性败血症的诊断概率 如果运用传统统计软件和统计方法，我不可能完成这项工作。JMP Genomics是成功的关键。 ——Ray Langley 洛夫莱斯呼吸道疾病研究所 助理研究员 挑战 更准确地对败血症患者病情的’严重程度作出预测。 解决方案 一个医疗研究团队运用SAS公司旗下的JMP??Genomics软件对含有上万个化合物的数据组进行研究。该研究团队成员均非统计专家，但JMP??Genomics软件让他们得以快速、准确地检验复杂数据组。统计专家证实其分析结果有效。 结果 JMP??Genomics软件帮助该医疗研究团队进行一项可区分轻度败血症和重度败血症病例的血液检查，提醒医师重视需立即住院治疗的病患。该项研究结果也可能提高其他传染病的医治效率。 2012年7月11日，《纽约时报》的读者们读到了关于已故12岁少年、居住于纽约皇后区的Rory Staunton的故事。 Rory周二晚放学回家，胳膊上有一块擦伤，那是他在体育课上打篮球时做“插水”假动作时留下的。周日，Rory死于败血症性休克，那是败血症的一种重度表现。败血症是由身体对感染所作反应引起的、可能致命的并发症。 《纽约时报》的这则报道引起了公众对败血症的关注。据美国疾病控制与预防中心的数据，美国每年死于败血症的人数大于20万，比死于乳腺癌、直肠癌、胰腺癌和前列腺癌加起来的总人数还多。据估计，全球范围内每年有500多万人死于败血症。 Rory病逝前一年，美国联邦医疗保健研究与质量局报告指出，2000-2008年间，治疗败血症的医院数量翻了一番还不止。研究员们对该疾病的研究投入持续增长以期望更好地理解这种疾病，而在研究中，JMP Genomics扮演着关键角色。 这张JMP??Genomics图表展示了根据代谢体数据所得到的败血症结果及并发症的主成分分析。病患在血液透析（绿色）、肝脏疾病（蓝色）、败血症死亡案例（橙色）、败血症性休克（红色）以及败血症存活案例（青绿色）等方面数据有明显分别。 2013年，SAS旗下的JMP Genomics软件帮助一个医疗研究团队进行一项血液检查，旨在预测败血症在人体全身扩散进程、以及预先诊断病患情况为轻度或重度感染。该团队由美国密苏里州堪萨斯市儿童慈善医院及附属诊所儿科基因组医学主管Stephen Kingsmore领导，如今，他们正致力于研制出一款可助内科医师作出快速、准确诊断的手持设备。“JMP Genomics是我们评估数据质量，实现数据转换、数据可视化以及数据分析等的主要应用软件。”Kingsmore如是说。他还曾任美国国家基因资源中心主席兼CEO。 从混合模式的标准数量遗传分析，到复杂的关联作图，JMP Genomics已经被运用于精神分裂症研究、草原植物用作生物燃料的可能性及其它更多研究。JMP软件将快捷的点击式操作、动态交互式图形与SAS强大的基因组数据集探索分析完美结合。 “如果运用传统统计软件和统计方法，我不可能完成这项工作。JMP Genomics是成功的关键。”Ray Langley，位于美国新墨西哥州阿尔布开克（Albuquerque）的洛夫莱斯呼吸道疾病研究所助理研究员、学术期刊上本项目论文 Raymond J. Langley et al, “An Integrated Clinico-Metabolomic Model Improves Prediction of Death in Sepsis,” Science Translational Medicine, July 24, 2013. 的第一作者如是说。 “鉴于我们必须筛选的巨大数据量，这一研究成果可称得杰作。”Langley表示，“我认为，在观测病患人数上，考虑的临床因素数量上，运用的前沿技术上，以及我们收集、分析并验证的多重数据集上，这都是一项突破性的临床研究。这项研究一定会为未来的异质性疾病研究提供参考。” “概括地说，就是让数据‘讲故事’。” 疾病图 败血症是由感染扩散至全身引起的，可能引起肺、肾、肝等器官的功能衰竭。败血症的起因是身体免疫系统对感染的反应；当化合物进入血液对抗身体对感染的过度反应时，败血症就进一步发展，引起炎症。其症候包括高烧、肤色泛红、心率加速等；如病情严重，还可能出现血压降到安全值以下、身体器官停止运作等症状，数小时内便可致人死亡。 Langley于2008年加入这一研究项目，当时他正在美国国家基因资源中心进行博士后学位课程研究。该项目主要目标是，帮助医生确认病患是否患有败血症、并对败血症患者的病情发展进行预测。患者化验于2005年进行，采样点包括美国底特律的亨利福特医院、北卡罗来纳州德罕（Durham）的杜克大学医学中心以及退伍军人