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Liaoning University Bioinformatics Liaoning University Bioinformatics bioinformatics 蛋白质家族 张力 同一蛋白家族的多序列联配可以用来推断结构、功能和家族关键氨基酸的信息。多序列联配信息的表示的表示方法有很多种，包括联配本身、一致序列、保守序列和残基模式、序列轮廓以及其他的序列家族的概率模型（隐马可夫模型）。 一致序列：在两个或多个同源序列的每一个位置上多数出现的核苷酸或氨基酸组成的序列。 PROSITE：PROSITE数据库是与蛋白质家族成员关系有关的序列模式数据库。 例如 序列模式：[LIVM]-[ST]-A-[STAG]-H-C 代表有6个氨基酸残基组成的序列，[LIVM]表示L、I、V、M中的一个残基，[ST]表示S或T，然后是A，然后是S、T、A或G，然后是H，然后是C 还有一些其他表示方法，比如x 2 ，表示任意的两个氨基酸，x 2,4 ，表示任意的2到4个氨基酸， ST ，表示除S和T之外的任意一个氨基酸 / 例子：在prosite搜索酵母的Hexokinase（己糖激酶） 己糖激酶信号的序列模式为： [LIVM]-G-F-[TN]-F-S-[FY]-P-x 5 -[LIVM]-[DNST]-x 3 -[LIVM]-x 2 -W-T-K-x-[LF] 酵母的153-178位氨基酸的序