比较基因组学应用教程.pptVIP

下载本文档

69
0
约1.24万字
约 81页
2016-11-24 发布于湖北
举报
版权申诉

比较基因组学应用教程.ppt

1、原创力文档（book118）网站文档一经付费（服务费），不意味着购买了该文档的版权，仅供个人/单位学习、研究之用，不得用于商业用途，未经授权，严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等，侵权必究。。
2、本站所有内容均由合作方或网友上传，本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺！文档内容仅供研究参考，付费前请自行鉴别。如您付费，意味着您自己接受本站规则且自行承担风险，本站不退款、不进行额外附加服务；查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档，您可以点击这里二次下载。
3、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等，请点击“版权申诉”（推荐），也可以打举报电话：400-050-0827(电话支持时间：9:00-18:30)。
4、该文档为VIP文档，如果想要下载，成为VIP会员后，下载免费。
5、成为VIP后，下载本文档将扣除1次下载权益。下载后，不支持退款、换文档。如有疑问请联系我们。
6、成为VIP后，您将拥有八大权益，权益包括：VIP文档下载权益、阅读免打扰、文档格式转换、高级专利检索、专属身份标志、高级客服、多端互通、版权登记。
7、VIP文档为合作方或网友上传，每下载1次，网站将根据用户上传文档的质量评分、类型等，对文档贡献者给予高额补贴、流量扶持。如果你也想贡献VIP文档。上传文档

RG* refers to Reference Genome aNumber of orthologous genes bNumber of collinear blocks cPercentage of genome coverage dNumber of paralogous genes eNumber of duplicated blocks fAsterisks for the wheat and barley genomes highlight the highly saturated gene-based genetic maps used in the analysis Ancestral grass karyotype (AGK) reconstruction Model for grass chromosome evolution and shuffling 591 pre-miRNAs 582 pre-miRNAs 368 pre-miRNAs 136 5p expression 28 3p expression 29 libraries (RPM normalized) 204 dynamic expression mapping 8 96 90 Tissue-specific Abiotic stress-specific 214 not expressed (Read counts 2) 9 identical precursors 194 switch switch RNA GSM647195 GSM816744 GSM722128 GSM647193 GSM647192 GSM647194 GSM816743 GSM816740 GSM816699 GSM278572 GSM693280 GSM816741 GSM571078 GSM816735 GSM816716 GSM693279 GSM278571 GSM816738 GSM571077 GSM816696 GSM816698 GSM816697 GSM816694 GSM816720 GSM816687 GSM943193 GSM816718 GSM816732 GSM816690 GSM816692 GSM816742 GSM816706 GSM816710 GSM816712 GSM816726 GSM816728 GSM816724 GSM816722 GSM816704 GSM816708 GSM816714 GSM686040 GSM686039 1 0.8 0.6 0.4 0.2 0 60 50 40 30 20 10 70 osa-miR444c (5p/3p) Dynamic arm expression of osa-miR444c in different libraries Shoot Seedling Panicle Root Control Drought Salt Cold Heat ColdSalt HeatDrought HeatSalt Control Drought Salt Cold Heat ColdSalt HeatDrought HeatSalt Control -P -S -N -K -Ksalt Control -P -S -N -K -Ksalt Drought Heatmap of arm swtiching of Osa-miRNAs in different tissues and abiotic stresses Different tissues Different abiotic stresses Tissue-specific and overlap of pre-miRNA harboring arm switching under abiotic stresses 34.6% 98/283 37.7% 121/321 22.4% 38/170 24.4% 49/201 Clean reads (×106) Unique reads (×105) Length (nt) A 灰飞虱小RNA高通量测序（混合样品） miRNA reads Conserved miRNA with precursor in L. striatellus M 50 bp 100 bp Stem-loop RT-PCR和测序验证 miRNA家族在不同动物中的保守性 miRNA靶标基因的GO分析表 RNA-seq检测到与肺癌相关的基因变化类型谢谢！ * * * * Phylogenetic Analysis of Alpha Prolamin Genes in Foxtail Millet,