与甘蓝中心柱长相关联的EST-SSR标记解说.docVIP

园 艺 学 报 2014，41（7）：1344–1354 http: // www. ahs. ac. cn Acta Horticulturae Sinica E-mail: yuanyixuebao@126.com 收稿日期：2014–03–10；修回日期：2014–06–04 基金项目：国家重点基础研究发展计划（‘973’）项目（2012CB1139）；国家现代农业产业技术体系建设专项资金项目（CARS-25）； 国家‘863’计划课题（2012AA100101，2012AA100202）；农业部园艺作物生物学与种质创制重点实验室项目 * 通信作者 Author for correspondence（E-mail：jwcgyq@，zhuangmu@） 与甘蓝中心柱长相关联的EST-SSR标记分析 孙朋朋1,2，刘基生2，张扬勇2，方智远2，刘玉梅2，杨丽梅2，龚义勤1,*， 柳李旺1，李占省2，庄 木2,* （1南京农业大学园艺学院，南京 210095；2中国农业科学院蔬菜花卉研究所，北京 100081） 摘 要：利用40个EST-SSR标记，对100份甘蓝自交系组成的自然群体进行遗传结构分析，采用 TASSEL3.0软件的GLM（general linear model）和MLM（mixed linear model）模型，对甘蓝中心柱长和 中心柱长/球高比值性状进行关联分析。结果显示供试材料可分为3个亚群；EST-SSR位点间有较高的多 态性和一定程度的连锁不平衡；以GLM模型分析，共检测出5个标记的7个位点与中心柱长性状相关联， 2个标记的3个位点与中心柱长/球高性状相关联，其中2个位点同时与两个性状相关联；以MLM模型分 析，共检测出3个标记的4个位点与中心柱长性状相关联，1个标记的2个位点与中心柱长/球高性状相 关联，其中2个位点同时与两个性状相关联。GLM和MLM两种模型同时检测到了与中心柱长/球高相关 联的1个标记的2个位点以及与中心柱长相关联的3个标记的4个位点。 关键词：甘蓝；EST-SSR；遗传多样性；群体结构；关联分析 中图分类号：S 635.1 文献标志码：A 文章编号：0513-353X（2014）07-1344-11 Analysis on EST-SSR Markers Associated with Core Length in Cabbage SUN Peng-peng1,2，LIU Ji-sheng2，ZHANG Yang-yong2，FANG Zhi-yuan2，LIU Yu-mei2，YANG Li-mei2， GONG Yi-qin1,*，LIU Li-wang1，LI Zhan-sheng2，and ZHUANG Mu2,* （1 College of Horticulture ， Nanjing Agricultural University ， Nanjing 210095， China ；2 Institute of Vegetables and Flowers ， Chinese Academy of Agricultural Sciences ， Beijing 100081， China ） Abstract：Forty EST-SSR markers were applied for the genetic structure analysis of a natural population comprised 100 cabbage inbred lines，and association analysis between markers and two agronomic traits on core length were subsequently performed using GLM（general linear model）and MLM （mixed linear model）programs of TASSEL3.0 software in this study. Population genetic structure analysis showed that 100 cabbage accessions were composed of 3 subpopulations，and high polymorphism and various degree of linkage