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三、酵母tRNA的剪接 前面的剪接反应是依赖于一些短的保守序列,转酯反应与连接反应同时进行。在酵母tRNA的剪接过程中,采用了不同的机制,链的断裂与连接是两个独立的反应。 四、 RNA的末端修饰 II 类内含子的结构域(domain)5和6的结构,类似于和核RNA内含子剪接体中U6-U2及U2-内含子配对形成的结构。 II类内含子(group II) (II 类内含子) (核RNA内含子剪接体) 三类内含子剪接模式的比较: 核RNA内含子和II类内含子的剪接很相似; 靠近3’剪接位点的一A的2-OH 攻击内含子5末端,形成索套(lariat)中间体。 都是通过酯基转移反应进行; tRNA 的剪接与成熟 (真核生物) OH 3’ACC 5’ N P 2’ 3’ Kinase + GTP 3’ACC 5’ Endonuclease 环化磷酸二酯酶 CPDase 内切核酸酶 激酶 3’ACC 5’ N P 2’ 3’ P 腺嘌呤合成酶、 Ligase + ATP 3’ACC 5’ N P 2’ 3’ P pP Ligase 3’ACC 5’ N P 2’ 3’ P 2’磷酸转移酶 3’ACC 5’ N 2’ 3’ P (一)mRNA的5端修饰 1、加帽 在磷酸酶的作用下,将5 ′-端的磷酸基水解,然后再加上鸟苷三磷酸,形成GpppN的结构,再对G进行甲基化。 新加的G以反方向与5′连接,这一结构称为帽子(cap)结构 5′ 5′ Gppp + pppApNpNp... ↓ 5′ 5′ GpppApNpNp... + pp + p 2、甲基化 只在末端G的7位甲基化的帽子称为帽子0(cap 0),写作m7GpppX; 若第二个核苷酸2-OH甲基化,则称为帽子1(cap 1),写作m7GpppXm; 若第三个核苷酸2’-OH甲基化,则称为帽子2(cap 2),写作m7GpppXmpYm。 mRNA 3末端的产生 Pol I 和pol III 在特定的位点终止合成 (二)RNA的3末端修饰 Pol II无特定终止位点? Pol II无特定终止位点,3’-OH末端通过在特定位点切割后加上poly(A)来形成。 末端的AAUAAA序列作为切割和添加poly(A)的位点的信号。 产生正确的末端结构需要核酸内切酶(由CFI和CFII组成)切割RNA; 特异组分(CPSF)识别AAUAAA序列; 激发因子CstF,结合在切割位点下游一富含G-U的序列。 poly(A)聚合酶(PAP)合成poly(A)尾部; * * * * * * * * * * * 第五节 RNA剪接和加工 大多数真核生物编码蛋白质的基因是不连续基因,内含子与编码序列一起被转录。因此mRNA的原初转录产物是分子量很大的前体,分子大小极不均一。这些高分子量、不均一的核内RNA称为核内不均一RNA(heterogeneous nuclear RNA, hnRNA)。 hnRNA 经加工和选择性拼接,产生有功能的成熟的mRNA,释放到细胞质中。 翻译 转录 末端修饰 剪接 RNA剪接、加工均发生于核内 RNA剪接 三类剪接系统: 高等真核生物中,外显子-内含子边界、位于内含子内的短的保守序列,由一复杂的核蛋白组成的剪接器复合体对其识别,并切除内含子。(核RNA剪接) 有两组不同的内含子可发生自我剪接。(自我剪接RNA——Ⅰ类、Ⅱ类自剪接内含子) 酵母核前体tRNA内含子的切除。 除核前体tRNA外,RNA的剪接都通过酯基转移(transesterification)反应切除。 内含子两端没有长的同源或互补序列,但有极短的保守的共有序列,左端(上游)为GT,右端(下游)为AG。这一现象称为GT-AG规则。在RNA中则为GU-AG。 左端的位点也叫供体位点(donor site)或者5,右端也叫受体位点(acceptor site)或者3。 一、 核RNA的剪接 (一)核RNA剪接的模式 原则上5 ′可以和任何3 ′ 位点进行剪接。 剪接位点是通用的; 剪接器无组织特异性。 剪接存在索套(lariat)结构,需三个序列: 5′剪接位点; 3 ′剪接位点; 分支点 剪接的第一步,是内含子5’ 端与上游外显子之间断裂; 5’端与内含子中靠近3’端的一A 残基2’-OH 形成一索套形中间产物; A 所在位点称为分支位点(branc
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