基因组学第8章基因组活性的调控资料.pptVIP

特异免疫球蛋白的合成 免疫球蛋白类型转换 染色质结构改变 常染色质、异染色质间的改变 X染色体失活 polycomb基因家族 polycomb通过引发异染色质形成使某些基因组片段沉默 三胸蛋白（trithorax） 基因组的反馈环调节 转录因子表达后结合于自身基因的顺式元件，反馈调控自身基因表达 MyoD转录因子 果蝇的变形蛋白 基因组活性的其他调控方式 RNA调控基因组转录后活性 表观遗传调控 用转录因子将体细胞基因组重编程——诱导多能干细胞(iPSCs) RNA调控基因组转录后活性 调控RNA是小RNA 细菌中RNA介导的调控 1）参与质粒的复制调控 2）基因表达调控 真核生物中RNA介导的调控 1）RNAi是真核生物的主要调控方式 2）miRNA分子的合成与功能 RNA干扰（RNA interference,RNAi ） 真核生物中存在多种类型很短的RNA分子，它们能抑制或沉默那些与其具有同源序列的基因的表达，这种调控机制称为RNA干扰(RNAi)，也称为RNA沉默（RNA silencing）。 多种表现方式： 1）抑制mRNA翻译 2）降解mRNA 3）沉默指导mRNA转录的启动子 RNAi是真核生物的主要调控机制 调控的小RNA来源： 源于双链RNA前体的siRNA(small interfering RNA); 源于细胞内基因编码RNA前体的miRNA(microRNA) 小RNA抑制同源靶基因表达的途径： 1）引起靶基因编码mRNA的降解 2）抑制mRNA翻译 3）对靶基因所在染色质进行翻译修饰而沉默其转录。 基因检测：掀起你的“盖头”来 突变先天遗传与兔子耳朵上的焦油 预防“碎玉”保“瓦全”，有无必要 治疗 针对基因突变的“神药” 常见的家族遗传病 结直肠癌 乳腺癌 胃癌 高血压 糖尿病 第八章 基因组活性的调控 瞬时 永久性或半永久性 基因组活性调节方式 基因组活性调节方式 基因组 蛋白质组 细胞 基因组活性： 1）瞬时改变，受胞外环境影响，可逆转 2）永久性或半永久性改变，不可逆转或特性逆转?细胞分化具有特定生理功能 基因组活性的转录后调控：调控RNA的作用 发育过程中基因组活性的调控 基因表达途径中可进行调控的步骤举例 基因组活性的瞬时变化 基因组活性的永久性和半永久性变化 发育过程中基因组活性的调节 第一节 基因组活性的瞬时变化 细胞对外界刺激应答 1) 单细胞生物：营养物质改变 2) 多细胞生物：激素、生长因子和相关化合物 作用方式 1) 直接方式：作为信号物质直接进入细胞 2) 间接方式：通过与细胞表面受体结合，将信号间接传入细胞 通过细胞外信号化合物的进入进行的信号传递 细胞表面受体介导的信号传导 通过细胞外信号化合物的进入进行的信号传递 信号物直接影响基因组活性的三种方式： 信号物是蛋白分子，影响转录起始复合物的组装，或与剪接增强子或抑制子相互作用。 信号化合物能影响一个已知蛋白分子的活性。 信号化合物通过一个或多个中间分子影响一个已知蛋白的活性 直接作用于基因组的胞外信号蛋白 乳铁蛋白是一个可以作为转录因子的胞外信号蛋白 蛋白特征： 1）具有有效跨膜运输所需的疏水性 2）具有通过水相胞质的亲水性 存在于牛奶、血液 与免疫细胞基因组结合导致其活化 一些进入细胞的信号物质直接影响已经存在的调节蛋白 原核生物：操纵子 真核生物：普遍方式 例子1：啤酒酵母铜离子调控的基因表达 例子2：类固醇类激素（雌激素、糖皮质激素等） 类固醇激素信号 类固醇激素受体 所有类固醇激素受体结构上是相似的 典型类固醇激素受体和核受体的应答元件序列 胞外信号入胞后间接作用于转录因子 细菌：代谢物阻抑 例子：胞外葡萄糖水平决定乳糖操纵子是否启动 1）葡萄糖存在时优先利用葡萄糖 2）葡萄糖抑制腺苷酸环化酶的活性，降低cAMP水平 3）cAMP存在时，代谢物活化蛋白（CAP）结合DNA，激活乳糖操纵子 细胞表面受体介导的信号传导 跨膜受体结构 1）离子通道偶联的受体 2）G蛋白偶联的受体 3）激酶受体 酪氨酸 丝氨酸 苏氨酸 细胞表面受体被胞外信号结合激活导致基因组活性蛋白的直接活化 转录因子STAT 表面受体是酪氨酸激酶家族成员，能直接活化STAT 酪氨酸激酶相关受体，通过中间物JAK起作用 STAT结合于DNA序列：5’-TTCCGGGAA（回文序列） 受体和基因组之间的多步骤信号转导 级联途径——受体作为最终使一个或多个转录因子激活或失活的一系列步骤中的第一步。 哺乳动物中较为重要的级联途径： MAP（有丝分裂原活化蛋白）激酶系统 Ras系统