基因和基因组.解说.ppt

2000年6月26日克林顿宣布人类基因组草图绘制完成 此后，人类基因组研究进入绘制“完成图”的阶段 年 发表人类基因组初稿 完成10万个人类全长cDNA的测序 　2001 年 2 月人类基因组计划公立阵营在 15 日出版的《nature》杂志、塞莱拉公司在 16 日出版的《science》杂志上公布各自的人类基因组测序草图 2001年2月12日，参加绘制人类基因组图谱的美、英、日、法、德、中6国科学家公布了更加准确、清晰、完整的人类基因组图谱，并指出人类基因总数只有 3 ~ 3.5万个, 编码序列占2%。 2001年7月10日，中国“人类基因组计划”重大项目秘书长杨焕明教授宣布：在人类基因组完成图的绘制工作中，中国已率先超额（1.13%）完成所承担的任务。 人类基因组计划的研究概况 2003.5.28—2003.6.2 冷泉港 人类基因组完成图发布会 2003 年人类基因组计划完成 基因组(genome)是德国遗传学家H. Winkler在1920年将gene（基因）和chromosome(染色体)两个词缩合而创造的一个新词，意思是指染色体上的全部基因。几十年来，随着分子生物学的发展，其含义扩展为在个体水平代表一个个体所有遗传性状的总和，在细胞水平代表一个细胞所有不同染色体（单倍体）的总和，在分子水平代表一个物种所有DNA分子的总和。 基因组学概念及范畴 以分子生物学技术、计算机技术和信息网络技术为研究手段， 以生物体内全部基因为研究对象， 在全基因背景下和整体水平上探索生命活动的内在规律及其内外环境影响机制的科学。 （一）遗传图 （二）物理图 （三）序列图 （四）基因图 HGP基本内容 一、 遗传图谱（连锁图谱） 概念：指基因或分子标记在染色体上的相对位置与遗传距离，用厘摩（cM）表示。 1cM的遗传距离表示在100个配子中有1个重组子。在哺乳动物中，遗传图谱上1cM的距离大约相当于物理图谱上1,000,000bp。 人类基因组的全长约3600cM 人类基因组的物理图是指以已知核苷酸序列的DNA片段（序列标签位点，STS）为“路标”，以碱基对（bp，kb，Mb）作为基本测量单位（图距）的基因组图。 STS是基因组中任何单拷贝的长度在100～500bp之间的DNA序列，与核酸内切酶识别序列相关联。 物理图主要内容是建立相互重叠连接的“相连DNA片段群”。 物 理 图 序 列 图 人类基因组的核苷酸序列图是分子水平上最高层次、最详尽的物理图。测定总长约1米、由30亿个核苷酸组成的全序列是人类基因组计划的最终目标。 人类所拥有的基因位点都是相同的，不同种族、不同个体的基因差异(人类基因组的多样性)以及“正常”与“疾病”基因的差异，只是同一位点上的等位基因的差异。 人类基因组计划所提供的人类核酸序列图，蕴藏了决定我们生、老、病、死的所有遗传信息，将成为人类认识自我、改造自我－使人类健康长寿的知识源泉，为21世纪现代生物学和医学奠定了基础。 在识别基因组所包含的蛋白质编码序列的基础上绘制的结合有关基因序列、位置及表达模式等信息的图谱。 在人类基因组中鉴别出占具2%－5%长度的全部基因的位置、结构与功能，最主要的方法是通过基因的表达产物mRNA反追到染色体的位置。 基 因 图 基 因 图 CpG岛的应用 CpG岛(CpG island)：描述哺乳动物基因组DNA中的一部分序列，其特点是C和G的总和超过4种碱基总和的50%，即每10个核苷酸约出现一次双核苷酸序列CG。具有这种特点的序列仅占基因组DNA总量的10%左右。 从已知的DNA序列统计发现，几乎所有的管家基因(House-Keeping gene)及约占40%的组织特异性基因的5‘末端含有CpG岛，其序列可能包括基因转录的启动子及第一个外显子。因此，在大规模DNA测序计划中，每发现一个CpG岛，则预示可能在此存在基因。 基 因 图 计算机应用及cDNA策略 计算机应用：通过软件进行预测（生物信息学） cDNA策略：把特定组织中的mRNA分离出来，经反转录合成cDNA片段，建立EST位标，根据转录顺序的位置和距离绘制的图谱。 是染色体DNA某一区域内所有可转录序列的分布图，是基因图的雏形。 HGP对人类疾病基因研究的贡献 寻找遗传疾病基因的常规流程 HGP对生物技术的贡献 ： （1）基因工程药物 （2）诊断和研究试剂产业 （3）对细胞 胚胎工程的推动 HGP对制药工业的贡献 HGP对生物进化研究的影响 HGP带来的负面作用 第三节 后基因组时代 ( Postgeno