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Ch2. Genomic DNA, Genes 基因gene——具有遗传功能的DNA片段。 基因组genome——细胞内所携带的全部遗传信息DNA的总和;对多倍体生物指单倍体DNA的总和。 编码蛋白的结构基因 基因组DNA 复制转录的调控序列 功能尚不清楚的区域 病毒基因组 核基因组 原核生物基因组 真核生物基因组 线粒体DNA 核外遗传物质 叶粒体DNA 质粒DNA 非独立的基因组: 转位因子—能在基因组DNA中移动的DNA序列,不能独立存在,需插入核或核外DNA中。 2.1病毒基因组的结构 外壳蛋白:识别、侵袭特定的宿主细 胞,并保护基因组不被 核酸酶破坏; DNA(RNA):编码结构蛋白和少量调 调控蛋白。 不能独立复制,必需进入宿主细胞,借助细胞内一些酶类和细胞器才能得以复制。 病毒基因组的结构: 1.基因组较小,大小差异较大; 乙肝病毒DNA 3kb,编码4种蛋白质 痘病毒DNA 300kb,编码几百种蛋白 基因组越小,编码蛋白越少,对寄主依赖性越大。 2.化学组成多样; DNA病毒、RNA病毒 单链、双链 线状、环状 定义:核苷酸序列彼此重叠的2个基因为重叠基因overlapping genes,或称嵌套基因nested genes。 类型: ① 一个基因的核苷酸序列完全包含在另一个 基因中; ②两个基因的核苷酸序列部分重叠; ③两个基因的核苷酸序列的末端密码子相互 重叠。 实质:两个基因虽共用一段核苷酸序列,但其读码结构互不相同,编码不同的蛋白质。 意义:使DNA的利用率提高,是基因表达调控的方式之一。 目前,在少数原核生物(大肠杆菌、病毒)中发现,在少数真核生物中也发现了类似的基因重叠现象(果蝇)。 4.大部分DNA序列用于编码,只有很少序列不编码(非编码序列较少); 5. 基因组中功能基因丛集成一个或几个特定区域,构成多顺反子结构; 6. 除反转录病毒外,病毒基因组只有一个拷贝; 7.有的病毒基因组中具有宿主细胞基因组的结构特点; 2.2 原核生物基因组 细菌基因组的结构特点: 1. 拟核(类核)结构; 2. 存在多顺反子结构; 3. 除RNA基因外,基本是单拷贝的; 利于核糖体的快速组装,短时间内合成 大量核糖体。 4. 非编码序列相对较少; 5. 存在不同的功能识别区 复制起始区、复制终止区等 大肠杆菌基因组结构: 1. 基因组DNA在4000kb,估计有3500个基因,已确定的基因有900个,已确定有260个基因具有操纵子结构(75个操纵子中),每个基因平均长度1000bp; 2. 已确定的基因中,多数是与代谢有关的酶、核糖体蛋白; 3. 大多数基因是随机分布的,两条单链作为模板的概率基本相等; 4. 多数基因都是单拷贝。 2.3真核生物核基因组的特点 1.基因组较大, 低等真核生物:107-108 bp,较原核生物大10倍; 高等真核生物:5X108-1010 bp,某些植物和两栖生物可达1011 bp; 哺乳类生物大于2X109它们可编码100万个基因。 2.真核生物核DNA与蛋白质结合,形成核小体,再缠绕成染色质(染色体); 3. 基因组一般为双倍体(diploid); 4. 基因为单顺反子。一个基因单独转录,一个基 因 一条mRNA, 翻译成一条多肽链; 5. 存在大量重复序列,重复次数可高达百万倍; 6. 基因组中非编码序列多余编码序列,有大量的 冗余DNA; 7. 大部分基因有内含子,因此基因不连续; 8. 具有多个复制起点,而每个复制子的长度较小。 真核生物基因组的特点: 重复性、基因家族、不连续性。 基因组结构与进化的关系: 1.基因组的物质组成从多样 → 单一; DNA、RNA分工明确 单链、双链,线状、环状→ 双链线状 2. 基因组由小→ 大; 3. DNA的利用率越来越低;(多拷贝、非编码 区、基因不连续) 4. 调控序列增多,调控方式更复杂
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