临床蛋白质组学last-2014-11.ppt

课程相关信息 总学时数：36 教学目的和要求： 1. 掌握蛋白质组学的基本概念 2. 熟悉蛋白质组研究的基本技术 3. 熟悉利用组学策略设计医学课题的基本思路 4. 培养开展临床蛋白组学研究的能力 人类基因组图谱只有一张，而蛋白质组图谱每个器官、每个器官的每一种细胞都有一张 而且在生理过程和疾病状态时还会发生相应改变 发展的重点： **突破技术的瓶颈 **与“人类基因组”对接 **为解决人类健康与疾病问题做出更大的贡献 本 讲 纲 要 1. 临床蛋白质组学的内涵 定义，研究对象，实验设计，研究内容 疾病蛋白质组学，研究特点，可用技术 2. 临床蛋白质组学的研究概况 大型的研究计划及其现状 1 临床蛋白质组学的内涵 1-1 定义 *将蛋白质组学技术应用于临床医学研究 *通过基础医学与临床医学的结合，阐明疾病发生发展的机制，探寻疾病预防、（早期）诊断、治疗和预后判断的标志物和靶标，以期在人类重要疾病的防治方面取得重大的突破 *恶性肿瘤是其中的重点研究对象 是蛋白质组学的一个新的分支和十分重要的研究方向 是运用功能蛋白组学策略的典型 1 临床蛋白质组学的内涵 1 临床蛋白质组学的内涵 1-2 研究对象：直接来自临床 @手术取材或活检组织 @血液及其不同组分 @其余体液 脑脊液、唾液、尿液、支气管肺泡 灌洗液、泪液、精液、膝关节滑液 胆汁、乳头抽吸液、羊膜穿刺液等 @福尔马林固定-石蜡包埋的组织*** （formalin fixed paraffin embedded，FFPE） FFPE 从FFPE样品中获得生物分子（DNA、RNA和蛋白质等） 将为科学家们打开通往疾病研究路途上一个 藏有更多数据的宝库大门 近年，以FFPE组织为研究对象的蛋白质组学打破了以新鲜组织标本为研究对象的传统模式，其优势： **丰富的标本库存 **完善的临床资料 **“原生态”** 如何实现的? 有效提取全长蛋白用于定量分析的试剂盒（QIAGEN） Qproteome FFPE Tissue Kit Qproteome 2D FFPE Tissue Kit 例如：肿瘤组织与正常组织的差异表达研究 ** FFPE组织蛋白质组学技术的成功建立 极大地加速了临床蛋白质组学的研究 QIAGEN（快而精公司 ） ** 1984年，QIAGEN在德国成立 ** 是一家专业化致力于生物分子样品制备解决方案的跨国经营企业，总部位于德国 **QIAGEN产品的卓越品质和在应用中的出色表现使得其成为样品处理中标准的代名词 还不断有新的探索和研究 No best, only better. The HKUPP will provide guidelines or standard procedures for non-proteiuric urine proteomics; procedures for collection and storage of urine samples, and for preparation and separation of protein from the samples. The draft will be released in 2008. 1 临床蛋白质组学的内涵 1-3 实验设计 Healthy / Diseased Cancerous / Benign Drug resistant / Drug susceptible Treated / Untreated …… 1-4 研究内容 1）以临床样本研究疾病发生发展机制(如信号转导通路等） 2）从临床样本中发现和确认生物标志物 3）寻找新的治疗药物靶点 4）以组学的研究思路开展个体化治疗方案的研究 5）将组学技术用于新药研发过程（指导新药筛选、优化以及药物的临床前研究） 6）将组学技术用于药物的临床评价（疗效评价、药物毒性及药效学） 7）提高临床样品的收集、贮存等的质量 8）建立适用于临床实验研究的新技术(蛋白芯片、生物质谱等)） 9）开发相关生物信息学工具 1-5 疾病蛋白质组学 应用蛋白质组学