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第二章 蛋白质的结构与功能;主要内容;什么是蛋白质?;第一节 氨基酸的结构与性质;一、氨基酸(Amino acids)的分类;(二)氨基酸的分类;名称;Gly, G, 甘氨酸
Ala, A, 丙氨酸
Val, V, 缬氨酸
Leu, L, 亮氨酸
Ile, I, 异亮氨酸
Met, M, 蛋氨酸,
甲硫氨酸;包括: Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Met.
Gly 的侧链基团是氢原子, 因而具有最小的空间位阻,也最灵活。
Ala, Val, Leu, Ile , Met 是疏水的。;Ser, S, 丝氨酸
Thr, T, 苏氨酸
Cys, C, 半胱氨酸
Pro, P, 脯氨酸
Asn, N, 天冬酰胺
Gln, Q, 谷氨酰胺;包括: Ser, Thr, Asn, Gln, Cys, Pro
是亲水的,有-OH, -SH, Cys的 –SH参与二硫键的形成。
;脯氨酸(Pro), 亚氨基酸
Pro 出现在蛋白质空间结构的拐弯处和蛋白质表面,因为有五元环的平面,脆性,弹性最小。;Phe 和 Tyr 带苯环
Try 带吲哚环
Tyr的-OH 在蛋白质中具有重要功能(磷酸化、氢键形成等);Phe, F, 苯丙氨酸; Tyr, Y, 酪氨酸; Trp, W, 色氨酸;Lys, Arg, His: pH 7.0 (生理pH)时,带正电荷 R 侧链,亲水性。
Lys, Arg, His: R 侧链分别含有氨基、胍基、咪唑基。;Lys, K, 赖氨酸; Arg, R, 精氨酸; His, H, 组氨酸;Asp, Glu: pH 7.0 (生理pH)时,带负电荷 R 侧链,亲水性。
Asp, Glu: 除了在α-碳上有一个羧基外,R 侧链还有一个羧基。;Asp, D,天冬氨酸; Glu, E,谷氨酸;名称;二、氨基酸的性质;二、氨基酸的性质;22;甘氨酸的两段滴定曲线;aa;3.芳香族氨基酸的紫外吸收性质;芳香族氨基酸的紫外光吸收;三、氨基酸的主要功能;第二节 蛋白质的结构;蛋白质的分子结构包括:;30;一、蛋白质一级结构; (1)具有部分双键性质。肽键中-C-N-键的性质介于单、双键之间,不能自由旋转。;(2)多为反式(trans),也有顺式(cis);Pro的亚氨基肽键易形成顺式结构,特别顺应紧凑的转角。; (3)参与肽键形成的六个原子在同一平面上。
肽键的四个原子与相邻的两个α碳原子所组成的刚性平面,称为肽单位或肽平面(peptide unit)。
;36;37; (4)酰胺N带部分正电荷,羰基O带部分负电荷,这是由于N上的孤对电子与相邻羰基发生共振造成的。
;多肽链有两端;二、蛋白质的二级结构;1. α-螺旋(α-helix);42;43;44;2. β-折叠使多肽链形成片层结构;46;47
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