第章基因与基因组介绍.ppt

* Example of the improved high-throughput fingerprint gel.BAC DNAs are digested with HindIII and visualized on a SYBR-green-stained 1% agarose gel. Every fifth lane contains a mixture of marker DNAs; the sizes of selected marker fragments are indicated. 0, origin of fragment migration.(A physical map of the human genome.The International Human Genome Mapping Consortium. Nature 409, 934-941(15 February 2001)) * Heterozygosity was calculated across contiguous 200,000-bp bins on Chromosome 6. The blue lines represent the values within which 95% of regions fall: 2.0? ?10-4-15.8? ?10-4. Red, bins falling outside this range. The extended region of unusually high heterozygosity centred at 34?Mb corresponds to the HLA. c, Correlation of nucleotide diversity with GC content of each read (autosomes only). The GC content and heterozygosity of reads from the heterozygosity analysis was calculated after sorting of reads by GC content and separation into 10 bins of equal size. Each bin contains 150?Mb of aligned, high-quality sequence. 第五节 人类基因组计划 Section 5 Human Genome Project 2000年6月26日，美国、英国、法国、德国、日本和中国六国科学家同时向世界宣布人类基因组工作草图基本完成，绘制出人体97%的基因组，基中85%的基因组序列得到了精确测定，包含了人体约30亿个碱基对的正确排序。 一、人类基因组计划的由来与进展 ◆ 提出：由美国生物学家，诺贝尔奖获得者杜尔贝科(R. Dulbecco)于1986年在美国《科学》杂志上发表的一篇文章中提出。 ◆ 主要目标：测出人类基因组DNA长达3×109碱基对的序列，发现所有人类基因并阐明其在染色体上的位置，从而在整体上破译人类遗传信息。 ◆ HGP还包括对一系列模式生物体基因组的全序列测定，如大肠杆菌、酵母、拟南芥、线虫、果蝇和小鼠等。 ◆ 美国政府于1990年10月正式启动了这项将耗资30亿美元、为期15年的计划，预期在2005年完成人类基因组全部序列的测定。 ◆ 英国、日本、法国、德国的科学家先后加盟，遂扩展成国际性合作计划，并于1996年举行了国际合作的人类基因组大规模测序战略会议。 ◆ 1997年美国国立卫生研究院成立国家人类基因组研究所(NHGRI)。 ◆ 1999年7月，中国科学院遗传研究所人类基因组中心在国际人类基因组组织注册成功，负责测定全部序列的1%。 ◆ 1999年12月国际基因组首次完成人体染色体基因完整序列的测定。 ◆ 2000年4月美国塞莱拉(Celera)基因研究公司宣布，该公司已破译出一名实验者的完整遗传密码。 ◆ 2000年6月人类基因组工作草图基本完成。 二、我国人类基因组研究工作的历程与进展 ◆ 2000年4月提前完成人第3号染色体短臂上3000万个碱基对的工作草图。 ◆ 我国人类基因组研究相关工作： 建立了多民族人群的DNA样品库 疾病基因的研究 模式生物体基因组的全序列测定 三、后基因组时代的展望 ◆ 后基因组时代，亦称功能基因组学时代 ◆ 后基因组时代目标：揭示基因组的功能及调控机制 ◆ 核心科学问题包括： 基因组的多样性 基因组的表达调控与蛋白产物的功能 模式生物基因组研究等 四、单核苷酸多态性(SNP)与个体差异 SNP：指基因组中