转录组测序介绍.pptx

转录组的测序技术方法及当前进展; 一、转录组测序技术背景; 转录组？;转录组测序技术又称转录组高通量测序（transcriptome sequencing）或称为全转录组鸟枪法测序（Whole Transcriptom Shotgun Sequencing WTSS）把高通量测序技术应用到有mRNA逆转录生成的cDNA上，从而获得来自不同基因的mRNA片段在特定样本中的含量，这就是mRNA片段或mRNA-Seq，同原理，各种类型的转录本都可以用深度测序技术进行高通量检测。 原则上, 所有的高通量测序技术都能进行RNA测序。自2005年以来, 以Roche 公司的454 技术、Illumina 公司的Solexa 技术和ABI 公司的SOLiD 技术为标志的新一代测序技术相继诞生, 之后HelicosBiosciences 公司又推出单分子测序(Single molecule sequencing, SMS)技术。新一代测序又称作深度测序或高通量测序, 是相对于传统的Sanger 测序而言,主要特点是测序通量高, 测序时间和成本显著下降。各平台测序原理及序列长度的差异决定了各种高通量测序仪具有不同的应用侧重 ; 一、转录组测序技术背景;转录组测序流程; 一、转录组测序技术背景;转录组测序应用领域; 一、转录组测序技术背景;应用实例;;; 一、转录组测序技术背景;转录组测序技术的发展前景;;;;4. 转录组研究能够从整体水平研究基因功能以及基因结构, 揭示特定生物学过程以及疾病发生过程中的分子机理。RNA-Seq 作为 一种新的高效、快捷的转录组研究手段正在改变着人们对转录组的认识。RNA-Seq 利用高通量测序技术对组织 或细胞中所有RNA反转录而成的cDNA文库进行测序, 通过统计相关读段(reads)数计算出不同RNA的表达量, 发现新的转录本; 如果有基因组参考序列, 可以把转录本映射回基因组, 确定转录本位置、剪切情况等更为全 面的遗传信息, 已广泛应用于生物学研究、医学研究、临床研究和药物研发等。对于转录组的研究未来将更加深入。;