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蛋白质为什么摆造型？ 蛋白质其实很艺术 我们经常听说“蛋白质结构”“蛋白质变性”之类的话。通常所说的“蛋白质结构”是指蛋白质摆出的空间造型，“变性”就是它们本来造型的改变。那么，蛋白质如何摆出造型？又为什么要摆造型？这对人类有什么意义吗？? 一、搭出蛋白质的材料——氨基酸 要说蛋白质摆造型，不能不说氨基酸。氨基酸，顾名思义，就是带了氨基的酸。在有机物里面，一个碳原子通常有四个胳膊，每个胳膊可以抓一样东西。氨基酸里最核心的那个碳原子，一个胳膊抓了一个羧基（羧基是是一个碳原子上接了一个氧原子，还有一个带着一个氢原子的氧原子），这个羧基使它称为“酸”，跟女同胞们爱吃的那个醋之所以被称为“醋酸”的化学原因是一样的；另一只胳膊抓了一个氨基，所以叫“氨基”酸；还有一只胳膊比较低调，只抓了一个氢原子；所有的氨基酸都有三只胳膊所抓的东西是一样的。而另一只胳膊，所抓的东西各不同，也就是 “同为氨基酸家族的一员，差距咋就那么大”的原因。 可以说，不同氨基酸在化学结构上的差别只在于四只胳膊中的一只抓的东西不同。这个不同的东西，通常被称为“侧链基团”。侧链基团虽然只占了一只胳膊，其个头有时候比这个氨基酸的其它部分加起来还大。氨基酸的性格，也就取决于这个基团。如果它疏水，这个氨基酸也就被称为疏水氨基酸；反之，如果这个基团亲水，就被称为亲水氨基酸。当然，也有些侧链基团奉行中庸之道，即不明显亲水也不明显疏水。 “氨基酸”牌积木 当一个氨基酸碰到另一个氨基酸，一个会提供自己氨基上的氢原子，一个会提供自己羧基上的一个羟基——羟基就是前面说的那个带着氢原子的氧原子（“羟”这个字很有意思，各取了“氢”和“氧”的一部分，读音差不多是这两个字的反切音——前一个字的声母加后一个字的韵母），合成一个水分子招待客人，而去了氢的氨基和去了羟基的羧基（叫作“羰基”，一个碳一个氧）勾结起来，原来的两个氨基酸就变成了一个大的分子，被称为“二肽”。相应的二者勾结的那个地方就被称为“肽键”，而原来的两个氨基酸则被称为“氨基酸残基”——各自缺了一部分，要搭帮才能生存。。这个跟人类社会差不多，不同的人要团结成一个整体，总是需要每个成员作出一些牺牲或者磨平一些棱角。这个二肽还有一个羧基一个氨基，可以分别继续勾结别的氨基酸。到最后，可以形成一长串的氨基酸。最小的蛋白质由几十个氨基酸勾结而成，而大的蛋白质则多达几百上千。 二、造型的产生——为了和谐 这样的一串氨基酸残基，被称为蛋白质的一级结构。也就是说，它告诉我们这个蛋白质含有哪些氨基酸，是怎样连结的。被连在了一起的氨基酸残基难免与邻居们形成各种各样的邻里关系。有的地方形成一个像弹簧的那样的形状，叫做“阿尔法螺旋”，是一种比较稳定的邻里关系；有的地方形成类似上下折叠的样子，叫做“倍塔折叠”；还有一种直接拐弯的样子，称为“转折”。这些都是有序的结构，类似邻里之间有不同程度的联系。螺旋是很紧密一种联系，就象中国传统社会，早上谁家的鸡下了个双黄蛋，中午就传遍了全村。氨基酸序列上还有一些部分就象现代社会，邻里之间鸡犬之声相闻老死不相往来，同一单元住了几年还是不知道隔壁的男女是夫妻还是父女。这种结构叫做“无规卷曲”。这四种邻里关系的结构，在蛋白质科学上被称为“二级结构”，通俗说来就是邻里之间的关系。 氨基酸残基之间的连接虽然很紧密，但还是可以在一定范围内转动。不难想象，几十上百个残基都有一定的活动范围，总体来看那些相距比较远的残基还可以通过一定的作用力互相接近。疏水作用是最常见的一中，那些疏水的的残基，不喜欢外界的水而互相靠近；而那些亲水的残基则使劲往外挤去寻找更多的水。另一种重要的相互作用是静电力，有的侧链基团是带电的，同性相斥异性相吸的作用也造成序列上相距较远的氨基酸残基发生排斥或吸引。由于受到身边邻居的牵连和空间距离的限制，这些作用力最后会达到一种合适的平衡。总的来说，这种关系是基于大家高兴而存在的，没有太强的利益关联，也不很紧密。就象网络上的一群人，由于共同的爱好，经常互相来往，探讨一下共同感兴趣的问题什么的。由于空间的限制，比如这些人可能在北京、西北、华南、山东、四川、浙江。。。甚至在地球的另一面，联系很松散。但是有的氨基酸含有硫原子，如果另一个也含有硫原子，这两个硫原子就可能发生很紧密的联结。这样的一种相互作用远比疏水或静电作用强烈，被称为“二硫键”。就象一个在北京，一个在芝加哥，月老在俩人中间搭了根红线，他们之间的的关系就远比其它氨基酸在一起探讨科学问题强烈得多。 这样的几种远距离作用，使得氨基酸残基在空间里排列组合，再加上空间的限制和邻居的牵绊，最后会形成一个稳定的空间结构。这种结构被称为蛋白质的“三级结构”。两个或者多个具有三级结构的蛋白质结构，还可能组合成更大的结构，称为蛋白质的“四级结构”。 总的来说，蛋白质的氨基酸就象积木