Part-III-转录-4概述.ppt

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rRNA转录单位 rRNA前体 a 去除基因间序列 (cleavage, trimming) b 部分碱基经修饰 (modification) 成熟rRNA 某些真核生物(如四膜虫)rRNA前体含有intron, 需 splicing。 (三) tRNA 3’ACC 5‘ tRNA转录单位 tRNA前体 a 切除5‘前导序列 b 3‘末端CCA添加 (tRNA nucleotidyltransferase) c 拼接去除内元 d 部分碱基经修饰生成稀有碱基(如?,2mG) * * 地中海贫血症 1/4 Junction seq. mut. of Globin gene干扰mRNA成熟 * 剪彩 * b) Group II splicing model (Michel 1982) Junction sequence Branch Site of 7Nt upstream of 3’-junction seq. ● 5’----exon----- GUGCG---------B.S----Py AU ----exon---3’ 5’拼接位点 3’拼接位点 ----Py Pu Py Py U A Py--- 100% ● 在Branch Site 的中间和两侧存在一些短的序列,与其上游互成 IR,形成茎环结构 (但A不包含在 IR序列内, 从而被排除成芽状突起)。 5’--GUGCG--------------------PyPuPyPyUAPy-----PyAU—3’ intron IR IR 5’ G AU 3’ A Splicing mechanism intron IR IR A 5’ G AU 3’ Exon 1 Exon2 G A intron PyAU Mature RNA 转酯攻击位点 intron XOH AU 2‘ A 3‘ G “Lariat” intron 以上结果表明; ● 保守A以其2’-OH发动转酯反应 ● 剪接过程不需任何酶类与能量的参与, 剪接活性RNA自身催化完成。 c) Group III splicing model (Chambon) Junction sequence Chambon rule ● 5’---exon--- GU--------intron--------AG ------exon----3’ 5’拼接位点100% 94% 3’拼接位点 ● 7Nt branch site in upstream of 3’ junction seq. py X py U pu A py 5’---E1---AAUAGGUGA--------I1-----UACAGGUUG---E2-- ---E2--CUCAGGUACA-------I2-------UCAGGUUG---E3-- ---E3-------CCAGUAA---------I3-----UACAGGAA------E4-- ---E4-------AUGGUAA--------I4-------AAAGGU--------E5-- ---E5-------GAGGUAUAU----I5-------CCAGCAA------E6-- ---E6-----GCAGGUAUGG---I6-------GCAGCUU-----E7---3’ ● Intron与 Exon的连接处 存在部分同源的 consensus seq. Ovalbumin mRNA (6 Intron, 7 Exon) Chambon rule ● snRNA (small nuclear RNA) 60-300bp的小RNA分子,105-106个/细胞; Rich U (named snRNA U1—U6); 以核蛋白形式存在,即SnRNP (small nulear ribonucleoprotein particles); 与junction seq or Branch site间存在互补区域并参与剪接 ● spliceosome(拼 接体) 由

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