分子遗传学整理课程.docx

 PAGE \* MERGEFORMAT 38 Chapter 1: Genomes, Transcriptomes and Proteomes 1. 概述 基因组（Genome） ：指生物的整套染色体所含有的全部DNA或RNA 序列。基因组是地球上每一物种具有的生物学信息的存储库。 基因组学（Genomics） ：指研究生物的整个基因组 ，涉及基因组作图、测序和功 能分析的一门学科。 基因组所包含的生物信息的利用需要酶及其他参与基因组表达过程中一系列复杂生化反应的蛋白质的协同活性。 基因组表达的最初产物是转录组，即那些含有细胞在特定时间所需生物信息、编码蛋白质的基因衍生而来的RNA分子的集合。转录组由转录过程来维持。 基因组表达的第二个产物是蛋白质组 ，即细胞中那些决定细胞能够进行生化反应的所有蛋白质组分。这是通过翻译过程来完成的。 2.1 Genes are made of DNA 奥地利神父孟德尔1865年根据7个碗豆性状的实验提出了遗传因子假说 ，认为每个性状由遗传因子控制 ，并提出了遗传因子的分离与 自由组合两大遗传规律。 证明基因由核酸 (DNA或RNA) 组成的3个著名实验： 肺炎双球菌的转化试验 ；DNA是遗传物质 ②噬菌体感染实验；只有DNA是联系亲代和子代的物质 ③烟草花叶病毒的感染实验。RNA也是遗传物质 2.2 The structure of DNA A. Nucleotides and polynucleotides B. The model of double helix DNA 晶体X射线衍射 图谱 ?为揭示DNA分子的二级结构提供了重要实验证据 a. Watson and Crick (1953) 提出的 DNA双螺旋结构模型： ?DNA分子通常以右手双螺旋形式存在，两条核苷酸链反向平行，且互为互补链。 ?戊糖－磷酸骨架在分子的外铡 ，在分子表面形成大沟和小沟，碱基堆积于螺旋内部。 ?碱基间通过氢键相互连接 ，A 和T 以2个氢键配对， G和C 以3个氢键配对 。 ?螺旋中相邻碱基间相隔0.34nm ，每10个碱基对螺 旋上升一圈 ，螺距为3.4nm ，直径为2.37 nm 。 b. DNA双螺旋结构的稳定力： ??碱基间形成的氢键/ ??相邻碱基间的疏水堆积力/ ??碱基相互作用的范德华力 尽管氢键使得双链中的碱基间的配对具有特异性 （只有互补的 两条链之间才能形成DNA双链） ，但其对于双螺旋的总体上的 稳定性并无太大贡献。 核酸分子的稳定性的根源在于碱基对之间的疏水堆积力。作为芳香族化合物 ，碱基的平面使其不能在自由溶液中与水分子形成氢键 ，即它们是疏水的 。疏水效应使双链DNA 成为能量上最 为稳定的结构。尽管这种堆积作用在RNA 中也存在，但其在双链DNA中达到了最大化。 c. DNA双螺旋结构的类型: 三种形态的DNA ：A-DNA, B-DNA, Z-DNA 两类：右手螺旋和左手螺旋 3. RNA and the Transcriptome ?? 基因组表达的最初产物是转录组 ，即那些含有细胞在特定时间所需生物信息、编码蛋白质的基因衍生而来的RNA分子的集合 。 ?? 转录组中的RNA分子以及其他来自非编码基因的RNA都由转录过程产生。 1.? 稳定性差 2.? 主要以单链形式存在 3.2 细胞内的RNA组分 (mRNA/ rRNA / tRNA) 核小RNA(SnRNA) ：发现于真核生物细胞核中 ，与 前体mRNA剪接成成熟mRNA 的过程相关。 核仁小RNA（snoRNA） ：发现于真核细胞核的核仁区，在rRNA分子的加工过程中起到核心作用（比如在某个核苷酸位点上加上一个甲基）。 微小RNA（miRNA）和短干扰RNA（siRNA）：是调控个别基因表达的小RNA 。 3.3 Processing of precursor RNA 末端修饰 / 剪接 / 剪切/化学修饰 化学修饰在rRNA、tRNA和mRNA 中都存在；其中， mRNA 的化学修饰称作RNA编辑。 3.4 The transcriptome 转录组虽然不到细胞总RNA 的4% ，却是细胞中最重要的组分 ，因为它包含了基因组表达的下一个阶段中所要使用的编码RNA 。 转录组从不从头合成（denovo），一个细胞通过细胞分裂诞生时 就接收了其上一代的部分转录组 ，并维持一生。 各蛋白质编码基因的转录过程并不是导致转录组的合成 ，而是通过替换被降解的mRNA 来维持转