第一章核酸的生物化学1讲课.ppt

随从链的合成方式 (a) 以DNA为模板 合成RNA引物 RNA引物 随从链模板 (b) 在引物的3’端 合成新的DNA 新DNA 冈崎片段 (c) DNA聚合酶去除 引物并填补空隙 (d) DNA连接酶 使片段连接 连接 随从链也叫后随链 DNA复制叉处的结构 DNA ligase DNA polymeraseⅠ Old Okazaki fragment Okazaki fragment Primer Lagging strand template Primer Helicase/primase Newly synthesized leading strand Dimeric replicative DNA polymerase βsubunit “ sliding clamp” SSB Leading strand template DNA gyrase Primer 岗琦片段的连接 DNA polymerase Ⅰ DNA ligase 原核生物和真核生物的冈崎片段 细菌的冈崎片段长度为1000～2000个核苷酸，相当于一个顺反子（cistron）的长度；真核生物的冈崎片段长度为100～200个核苷酸，相当于一个核小体DNA的长度。 E.coli 的主要复制蛋白 酶或蛋白 功 能 DnaB蛋白 开始解链 引物酶 合成RNA引物 rep蛋白 解开双链 SSB（单链DNA结合蛋白） 稳定单股链区 DNA旋转酶（拓扑异构酶） 引入负超螺旋 DNA Pol Ⅲ全酶 合成DNA DNA Pol Ⅰ 去除引物、补充空隙 DNA连接酶 连接DNA片段 DNA复制的最基本条件 单链DNA模板 DNA聚合酶 引物（RNA或DNA） dATP、dGTP、dCTP、dTTP (简称 4×dNTP） 必要的无机离子(Mg2+、K+） DNA的反转录合成 （RNA-directed DNA polymerase，RDDP） （DNA-dirceted DNA polymerase，DDDP） DNA的人工反转录合成 引起DNA损伤的因素 DNA合成时碱基错配 电离辐射 紫外线照射 化学诱变剂 致癌病毒 DNA的损伤类型 DNA的突变类型 点突变 缺失突变 插入突变 置换突变 DNA的修复方式 光复活 切除修复 重组修复 SOS修复 DNA断链 DNA链内交联 DNA链间交联 DNA损伤的切除修复 第六节 RNA的生物合成 DNA指导的RNA合成（转录） RNA指导的RNA合成（复制） 转录体系的组成 DNA模板 ATP、GTP、CTP、UTP 简称4×NTP RNA聚合酶 一些蛋白因子 必要的无机离子 DNA上的基因 在DNA长链上，排列着许多基因 基因之间往往有间隔序列 基因之间也有重叠的现象 就一个基因而言，DNA双链的一条链为模板链，另一条链为编码链（意义链） 在一个DNA长链上，不同基因的编码链可以位于不同的单链上 描述一个基因的结构是描述其编码链 模板链、编码链与RNA的关系 DNA链上基因的排列 断裂基因的发现 1977年，当时在纽约冷泉港实验室从事研究工作的Richard Roberts发现，单个基因不仅可以由一个DNA片段组成，而且可以由数个受到不相干DNA片段隔离的DNA片段组成。生物体内存在的这种间断的基因，比早期研究的那些基因更加复杂，从而使上述有关遗传物质及其功能的流行概念发生了彻底的改变。 断裂基因的发现 同年，Phillip Sharp在研究腺病毒时，发现腺病毒的基因组由一条很长的DNA分子组成；在DNA分子中，至少有4个完全间断的DNA片段与1个RNA分子相对应。由此得出结论认为，基因遗传信息在基因组内是间断编码的。这一科学发现激励了科研人员的深入研究，不久便证实断裂的基因结构事实上是高等生物最常见的基因结构。 断裂基因的外显子和内含子 我们把一个基因中最终出现在成熟的RNA中的序列称为外显子（extron or exon），而把转录后从原初转录本中去掉的序列称为内含子（intron）。 断裂基因可以通过异源双链分析得到检测，即把克隆了的基因组DNA与mRNA杂交，电镜观察未互补的环。 细菌拟核的突环结构 黑腹果蝇染色质的电镜照片 真核生物染色体的核小体结构 染色质的基本结构单位是核小体（nucleosome），核小体的核心是一个蛋白质八聚体，由组蛋白H2A、H2B、H3和H4各2个组成，DNA以左手螺旋在组蛋白核心上盘绕1.8圈，共146bp。核小体之间连接DNA的长度随不同核小体而略有不同，平均每个核小体占DNA200bp。 染色体的组装层次