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摘要
摘 要
目的:
1、构建携带增强绿色荧光蛋白 (EGFP )的人膜联蛋白A10 基因 (ANXA10 )
过表达慢病毒,然后转染人肝癌细胞株 HepG2 。
2 、采用转录组测序的方法检测 ANXA10 过表达慢病毒对 HepG2 基因表达
谱所产生的影响,初步阐明 ANXA10 对 HepG2 生物学行为的影响、可能涉及的
基因及相关的信号通路,为原发性肝癌形成中的 ANXA10 作用的深入研究奠定
基础。
方法:
构建携带增强绿色荧光蛋白(EGFP )的人膜联蛋白A10 基因(ANXA10 )
过表达慢病毒 LV-ANXA10 ,体外培养的 HepG2 分为三组:实验组、空载体对
照组和空白对照组,各组分别转染 LV-ANXA10 、慢病毒空载体以及等量的
Polybrene (病毒及空载体以MOI=10 浓度转染),转染 72 小时后使用荧光倒置
显微镜观察增强绿色荧光蛋白(EGFP )的表达情况,从而来确定ANXA10 的转
染效率,转染后 96 小时和 120 小时分别提取三组细胞的 RNA 行转录组测序比
较三组细胞相同时间点及同组细胞不同时间点基因表达谱的差异,并采用 qPCR
验证部分差异表达基因。
结果:
1、ANXA10 过表达慢病毒能影响 HepG2 的基因表达谱。通过对转录组信
息的分析,发现在转染后 96 小时的空白对照组与实验组比较发生显著转录差异
的基因有 69 个,其中 26 个基因上调,43 个基因下调;空载体对照组与实验组
相比发生显著转录差异的基因有 53 个,其中 25 个基因上调,28 个基因下调;
空载体对照组与空白对照组比较发生显著转录差异的基因有 12 个,其中 8 个基
因上调,4 个基因下调。而在转染后 120 小时的空白对照组与实验组的比较中发
生显著转录差异的基因有 742 个,其中 110 个基因上调,632 个基因下调;空载
体对照组与实验组的比较中发生显著转录差异的基因有 313 个,其中 168 个基
因上调,145 个基因下调;空载体对照组与空白对照组比较发生显著转录差异的
基因有 36 个,其中 24 个基因上调,12 个基因下调。进一步研究发现在转染 96
小时及 120 小时,实验组与空载体对照组及空白对照组比较 VEGFA 、AKT3 、
II
万方数据
摘要
PIK3CA 的表达均是下调的,而空载体对照组与空白对照组比较无上述变化。
2 、采用荧光定量PCR 技术验证,其结果表明,两个时间点的实验组与空载
体对照组及空白对照组三组比较,实验组中 VEGFA 、AKT3 、PIK3CAmRNA 表
达明显下调,差异有统计学意义(P0.05 ),但空载体对照组与空白对照组相比
较无明显差异(P0.05 ),与转录组测序的分析结果吻合,从而证实 VEGFA 、
AKT3 、PIK3CA 在转染过表达慢病毒 ANXA10 的 HepG2 细胞和转染空载慢病
毒的 HepG2 细胞及 HepG2 细胞的表达的差异性。
结论:
1、ANXA10 过表达对 HepG2 基因表达谱有影响。
2 、ANXA10 过表达对人肝癌相关的细胞因子 VEGFA 、AKT3 、PIK3CA 可
能存在抑制效应。
关键字:慢病毒;膜联蛋白 A10 ;转录组测序
III
万方数据
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