分子模拟及药物设计高级培训班课程信息课程介绍moe是由加拿大.docVIP

分子模拟及药物设计高级培训班 课程信息 课程介绍 MOE是由加拿大CCG公司开发的功能全面、强大的分子模拟及药物设计软件。它包含50多个功能模块，涵盖从分子建模模拟、化学数据库计算及管理、小分子药物设计、生物药设计的方方面面。无论在工业界还是学术界，MOE均有非常广泛的应用。每年，应用MOE的计算结果发表在优秀SCI期刊上的论文多达6、700篇，而工业界亦有不少使用MOE设计药物成功上市的经典案例，例如2013年1月被FDA批准在美国上市的阿格列汀。 自2008年进入中国以来，MOE在国内工业界和学术界的应用日益普及。现在，每年中国用户使用MOE发表的SCI论文有近50篇。 随着应用的深入，我们深感有必要创建一个平台，方便广大的MOE使用者能够定期学习并交流， 提高在分子模拟及药物设计领域的应用水平----这是我们组织高级培训班的初衷所在。在课程内容安排上，除了介绍经典的分子模拟和药物设计应用外，我们每年都会随着科研和工业应用热点的变化，介绍新开发的定制功能，培训新功能的使用。 并希望能通过这个交流平台，更好地了解并满足国内MOE用户的需求，认真实践“服务科研”的承诺。热忱欢迎国内广大的分子模拟和药物设计领域的工作者，无论是资深学者，还是青年学子， 前来参加我们的培训班——在这里不仅可以学到知识， 还可以找到志同道合的朋友，更可以激发灵感，帮助您的科研工作更上一层楼。 课程内容 第一天 9:00-17:00 主题：小分子药物设计 08:00 – 08:50 签到 | 安装软件 08:50 – 09:00 主办方致辞 09:00 – 10:15 MOE基础介绍 A. MOE窗口介绍； B. 利用MOE获得和保存数据； C. MOE数据库介绍和化学信息学； D. 小分子化合物的构象搜索； 10:15-10:30 茶歇 | 交流 10:30-12:00 药物设计中的药效团建模 在MOE中构建药效团模型； 在药物设计中使用药效团； 12:00-13:00 午餐 | 休息 13:30-14:15 蛋白结构预处理 A. 蛋白结晶结构修正、质子化； B. 结晶水处理； 14:15-15:15 基于结构的药物设计 分子对接； 在PDE4复合物中交互构建Piclamilast； 15:15-15:30 茶歇 | 交流 15:30-16:00 激酶应用 16:00-17:00 基于片段的药物设计 骨架替换； 片段连接； 片段生长； BREED； 17:00-17:30 AutoGPA----MOE中的3D QSAR 第二天 9:00-17:00 主题：蛋白建模及生物药设计 9:00—10:15 蛋白比对、叠合及相似结构搜索 处理PDB文件； 处理蛋白构象； 基于保守区域的蛋白叠合； 基于结合口袋叠合蛋白； 基于配体叠合蛋白； 蛋白相似结构域搜索； 10:15—10:30 茶歇 | 交流 10:30—12:00 蛋白同源建模 普通同源建模 GPCR建模 12:00—13:30 午餐 | 休息 13:30—15:15 抗体建模及设计 抗体结构概览 抗体建模 互补决定区Loop构象采样 经典保守残基分析 15:15—15:30 茶歇 | 休息 15:30—17:00 蛋白设计 丙氨酸扫描 二硫键扫描 抗药性突变扫描 序列设计 蛋白沉聚性质分析 蛋白属性计算 第三天 9:00 - 17:00 定制开发、批量流程化及动力学模拟 9:00--10:45 SVL语言及开发范例介绍 10:45—11:00 茶歇 | 交流 11:00---12:00 MOE在KNIME环境下的工作流构建 12:00—13:30 午餐 | 休息 13:30 – 15:00 动力学模拟的基本方法和概念 15:00 – 15:15 茶歇 | 休息 15:15 – 17:00 动力学模拟应用实例