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转录及其调控 转录(transcription) 生物体在遗传信息传递过程中,以DNA为模板,在DNA依赖的RNA聚合酶催化下,以4种三磷酸核苷为原料,合成RNA分子的过程 原核生物转录 RNA聚合酶直接与模板DNA启动序列结合启动转录。 转录过程分为起始、延长和终止三个阶段。 起始需要RNA聚合酶全酶,延长仅需核心酶。 终止分为依赖ρ因子和不依赖ρ因子两种机制。 原核生物转录相关因子 ρ因子:六聚体蛋白、依赖ATP的解旋酶活性。 其他因子:nusA蛋白,识别新和成RNA分子中的终止信号 原核生物转录过程 原核生物转录起始: RNA聚合酶与模板DNA的启动子辨认结合 启动子:RNA聚合酶识别、结合并起始转录的一段高度保守性DNA序列 RNA链的延伸 核心酶向前移动, NTP不断聚合,RNA链不断延长 核心酶覆盖双链DNA和RNA复合物,向前推进,边解开螺旋边释放出新合成的RNA链,已经转录的区域中分开的DNA链又重新形成双螺旋 原核生物转录终止 终止子:DNA分子中终止转录的核苷酸序列 。 不依赖Rho (ρ)因子的转录终止 依赖Rho (ρ)因子的转录终止 真核生物转录 三种RNA pol识别不同启动子。 转录起始过程需要很多转录因子(transcription factor, TF )参与,按一定顺序与DNA形成复合物,协助RNA pol定位于转录起始点 RNA-pol前移会遇到核小体,转录延长过程中可以观察到核小体移位和解聚现象 真核生物转录终止于转录产物的加工密切相关 真核生物转录酶及相关因子 转录因子 (transcription factor, TF):是一类细胞核内蛋白因子,通过与顺式作用元件和RNA聚合酶的相互作用调节转录的活性 基本转录因子—RNA聚合酶结合启动子所必需的一组蛋白因子 特异转录因子—结合在转录核心元件以外的其他上游顺式作用元件的蛋白因子,通过DNA与蛋白之间的相互作用影响转录的效率 真核生物mRNA的成熟 5’端形成特殊的帽子结构 3’端切断一段序列并加上poly A尾巴 通过剪切去除由内含子转录来的序列 链内部核苷酸甲基化 1) 5’端加帽及其重要性 a. 翻译起始的必要结构,为IF3(起始因子)和核糖体对mRNA的识别提供信号 b. 增加mRNA的稳定性,保护mRNA 免遭5’外切核酸酶的攻击 c. 运输,有助于mRNA越过核膜,进入胞质 2) 3’端加尾及其功能 与mRNA从细胞核转送到细胞质有关 稳定mRNA结构,保持生物半衰期 与真核mRNA的翻译效率有关:缺失可抑制体外翻译的起始,含 poly(A) 的mRNA 失去 poly(A) 可减弱其翻译 稳定帽子结构 真核生物tRNA的成熟 真核生物rRNA的成熟 初始转录本为45S前体,18S,5.8S和28S rRNA 是一个转录本 5s rRNA前体独立于其他三种rRNA的基因转录 前体rRNA与蛋白质结合,然后再切割和甲基化 剪切和甲基化均需要小核仁RNA(snoRNAs)的参与 转录调控 基因表达是多级水平上进行的复杂事件,分为: 转录水平、转录后水平(加工及转运)、翻译水平及翻译后水平,但以转录水平的基因表达调控最为重要 转录调控涉及特异的转录调节蛋白与转录调控区DNA之间的相互作用,可产生正或负的调控效果 原核生物转录调控的特点 σ因子决定RNA聚合酶识别的特异性 操纵子模型的普遍性:多个功能相关的原核基因串联在一起,依赖同一转录调控区对基因的转录进行调节,以确保功能相关基因之间表达的协调性 以负性调节为主:阻遏蛋白与操纵基因结合,抑制转录起始 原核生物转录起始调控 操纵子的基本组成 1.乳糖操纵子 乳糖操纵子的协调调节 原核生物转录终止调控 依赖ρ因子的转录终止调控 不依赖ρ因子的转录终止调控 衰减子介导的转录终止调控 色氨酸操纵子的结构 色氨酸操纵子的转录调控机制 真核生物转录调控 瞬时调控:或称为可逆调控,相当于原核细胞对环境条件变化作出的反应 发育调控:不可逆调控,决定了真核细胞生长、分化、发育的全部进程 真核生物转录调控的特点 有多种RNA聚合酶(RNA polⅠ、Ⅱ、Ⅲ),单独没有活性,必须与转录因子共同作用 通过顺式作用元件和反式作用因子调节转录的起始 转录激活状态的染色质结构发生明显变化 正性调控占主导地位 真核生物转录前调控 染色质结构对转录的影响:具有转录活性的活性染色质 染色质DNA对DNaseⅠ更敏感 正转录的DNA甲基化程度降低 常缺乏组蛋白H1,其他核心组蛋白则被乙酰化或与泛素相结合而修饰 非常活泼的转录区,如许多真核生物的rRNA基因处,没有核小体结构 DNA的修饰:甲基化与去甲基化 DNA甲基化能关闭某些基因的活性,去甲基化则诱导了基因的重新活化和表达。 甲基化常发生在基因5′侧区的CpG
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