第一章核酸的化学组成介绍.pptVIP

一、核酸的一般化学组分 二、核酸的修饰组分 三、核酸及其组分的化学反应 四、核酸组分的分离鉴定 ;一、核酸的一般化学组分;1.组成核酸的碱基;1.组成核酸的碱基;核酸中除了5类基本的碱基外，还有一些含量甚少的碱基，称为稀有碱基。;碱基的结构特征;胺式亚胺式互变异构;酮式烯醇式互变异构;2.戊糖;糖环的折叠构象; 核酸中戊糖的五元糖环不呈一个平面，其中的C1’-O-C4’这3个原子一般在一个平面上，而C2’和C3’偏离平面0.05～0.06nm，这种偏离就使糖环具有不同的构象。若C2’或C3’偏离平面的方向与C5’同向，则称为内式（endo)构象；若与C5’反向，则称为外式（exo）构象。;（1）信封式 糖环的C2’和C3’中只有一个原子偏离平面则称为信封式折叠（Envelope,简写为E ）。如C2’-endo（2E),C2’-exo(E2)，C3’- endo( 3E) ,C3’-exo( E3 )。上述几种构象可分别以侧视简图表示：;（2）扭转式 糖环的C2’和C3’都偏离平面而且偏离方向相反称为扭转式折叠（Twist,简写为T ）。如C2’-endo -C3’-exo（23T), C2’-exo-C3’- endo(3T2) 。上述几种构象可分别以侧视简图表示：;3.核苷 (nucleoside);假尿苷?;4.核苷酸 (nucleotide);;核苷酸的衍生物; (2) GTP (鸟嘌呤核糖核苷三磷酸);（3）环化核苷酸cAMP 和 cGMP;（1）参与DNA、RNA的合成、蛋白质的合成、糖与磷脂的合成。 （2）在能量转化中起重要作用，ATP是生物体内能量的通用货币。 （3）是构成多种辅酶的成分：NAD、NADP、FAD、FMN和CoA。 （4）参与细胞中的代谢与调节（cAMP、cGMP）。;一、核酸的一般化学组分 二、核酸的修饰组分 三、核酸及其组分的化学反应 四、核酸组分的分离鉴定 ; 到目前为止，核酸中发现了近80种特别的组分，它们绝大多数是基本组分的衍生物，即在碱基或核糖的某些位置上附加或取代掉某些基团。把这些特别的组分称为修饰组分（也称稀有组分或附加组分）。 ;1.含有修饰碱基的核苷;3.含有C-C糖苷键的核苷;4. DNA的甲基化修饰;各种生物体中DNA甲基化的特征; DNA甲基化是表观遗传修饰的一个重要机制，它能从一个DNA序列产生不同模式的基因表达。它对正常发育至关重要，其功能失常可引起癌症和其他异常。 现在，研究人员利用高通量亚硫酸氢盐测序与单分子测序相结合的方法，以核苷酸分辨率获得了在胚胎干细胞中和在由它们形成的各种不同的细胞类型中DNA甲基化的一个分布图。该分布图显示了基因组中甲基化随细胞发育（如当胚胎干细胞成熟成为神经细胞时）而变化的特定点。 更具普遍意义的是，这种方法对于与发育生物学、癌症和再生医学相关的细胞群的表观遗传分析将会是有价值的。;DNA甲基化修饰的作用;DNA甲基化抑制基因转录的机理;用序列相同但甲基化水平不同的DNA为材料，比较其作为RNA聚合酶转录模板的活性，发现甲基的引入不利于模板与RNA聚合酶的结合，降低了其体外转录活性。 5-甲基胞嘧啶在DNA上并不是随机分布的，基因的5端和3’端往往富含甲基化位点，而启动区DNA分子上的甲基化密度与基因转录受抑制的程度密切相关。;一、核酸的一般化学组分 二、核酸的修饰组分 三、核酸及其组分的化学反应 四、核酸组分的分离鉴定 ;三、核酸及其组分的化学反应;（1）化学水解: N-糖苷键对碱稳定，磷酸二酯键一般也对碱稳定，但RNA分子由于核糖上有2’-羟基，在碱催化下能生成2’- 核苷酸和3’-核苷酸。 DNA一般不被碱水解。 N-糖苷键对酸不稳定，嘌呤比嘧啶的糖苷键不稳定，DNA比RNA的更不稳定。磷酸二酯键对酸也不稳定。DNA中的N-糖苷键比磷酸二酯键更不稳定，一般得到的是游离碱基，而不是脱氧单核苷酸，碱基脱落后变成多聚核糖磷酸，其磷酸二酯键因β-消除反应而断裂。 RNA中的磷酸二酯键的酸不稳定性小于嘌呤糖苷键而大于嘧啶糖苷键，所以RNA酸水解的产物一般是嘌呤碱基和嘧啶核苷酸。 酸水解DNA时，一般用甲酸、高氯酸或盐酸。高氯酸水解时，部分胸腺嘧啶会分解，用盐酸水解时则腺嘌呤稍有分解。 ; 水解DNA和RNA生成单核苷酸时，最常用的酶是核酸酶P1（桔青霉5’-磷酸二酯酶）和蛇毒磷酸二酯酶，它们可将DNA和RNA水解成5’-单核苷酸。得