表观遗传学2Epigeneticsandtheenvironmentemergingpatternsandimplications详解.pptx

 Epigenetics and the environment: emerging patterns and implications ;摘要;Environment factors;许多在生物体发育的某个特殊阶段的“表观遗传修饰”被证明是很稳定的，并且被维持在生物体的整体生命周期内。(如下图黑色实线箭头所示)。 然而,在某些基因位点,表观遗传标记可以很容易随时间改变(黑色虚线箭头所示) 。这种“表观遗传漂移”被认为既取决于环境因素和内在因素。这个图显示了一个示例的表观遗传漂变会导致DNA甲基化的损失,从而影响基因表达和生物体的表型。;表观遗传修饰的影响因素;DNA mthylation;Histon modification;Non-coding RNAs;提出五个关键问题; 一.哪些是被特定环境因素带来的发育和新陈代谢的表型？;Long-term effects on development;节肢动物： 1.蚜虫（表观变化：wingless?winged） ; 3.Honey bees（表观变化：工蜂和蜂王）;4.水蜡虫（表观改变：性别的决定）。可能的环境变化，在配子发育阶段温度的改变导致性别的决定。 Question： Whether temperature-dependent sex-determination in other groups of animals — including reptiles（爬行动物） (such as turtles and crocodiles) and fish species — is also mediated through changes in chromatin and DNA methylation, remains to be explored. ;植物： 1.春化现象（植物暴露在低温下，低温诱导植物提前开花。） 2.柳穿鱼（linaria vulgaris），一种植物。由于编码一种转录因子的基因DNA甲基化导致了花的形态发生可遗传的改变。 还有野外一些其他植物形态学上的差异，来源于特殊的DNA甲基化差异，推测可能是由于自然选择（selection）。;拟南芥的春化过程图： FLC是一个编码阻抑开花转录因子的一个基因。 A图：春化前，组蛋白H3上赖氨酸的三甲基化(H3K4me3;绿色圆圈所示)和FLC基因的表达有关，所以拟南芥被抑制开花。 B图：春化低温处理后，首先引起了COOLAIR antisense transcripts90的转录，随后起始复合物（PRC2--VRN2 、VRN5 、VIN3 ）的加入。Repressive chromatin 得到维持，防止了FLC的表达。 C图：春天来临，植物提前开花。;哺乳动物： 动物模型已经证明，营养和环境因素会导致其发育期间表观基因组的特殊位点的改变。 研究对象：小鼠的agouti viable yellow (Avy)等位基因。 Avy是一种依赖于环境而表达的等位基因，在发育期间，随机的建立表观遗传的状态。虽然它可以随机的维持下去，但是其表达量从一代到下一代被稳定减少。 特点：当逆转录转座子未被甲基化时，Avy 基因异常的表达，导致小鼠黄色毛，患有肥胖和糖尿病。;三种实验条件产生的结果：1.怀孕小鼠在暴露在有毒化合物和内分泌干扰物中， 都为黄色和小部分花色。2.正常条件下，由于甲基化程度不一样，产生的后代颜色， 不一样。3.提供甲基供体和辅酶，大部分都被甲基化，产生的是基本上是棕色的小鼠。 ;二.关于环境因素和观察到的表观遗传变化之间的联系,我们知道什么？;Developmental stage-dependent effects ;未来的研究方向：鉴别基因组中的哪些序列，随着时间的推移，其表观遗传能稳定不变，以及在什么范围内，不同组织间，表观遗传的维持过程是可以相比较的。;文中列举了Gestation 和Postnatal 这两个过程中，环境的影响。 Gestation effects 通过对怀孕小鼠喂食floate（叶酸）发现影响了甲硫氨酸的循环，从而影响了怀孕小鼠的Avy甲基化水平。同时有证据显示环境对胎盘和胚胎的影响也是不同的。 一个流行病学上的假说：胎儿的代谢行为来适应不好的营养条件，将会影响发育和生长，以及未来对疾病的易感程度。举得例子就是二战期间的荷兰，饥荒时期的怀孕母亲对后代的遗传。可能是由于叶酸摄取不足这个原因导致的。包括IGFR2印记基因。后期Waterland 和 colleagues实验证明：不同的营养挑战具有不同表观遗传的改变。 ;Postnatal effects