过渡文-上海中医药大学.docVIP

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第六章 第八节 分子生物学方法及其在中医研究中的应用 试述分子生物学实验的主要技术和方法 答题要点: (一)载体 常用载体如下: 1.质粒。质粒是一类双链、闭环的DNA分子,长度为3kb左右,存在于细菌体中,独立于细菌染色体之外进行复制和遗传的辅助性遗传单位。通过改造,使实验室常用质粒具备了以下几种特性:1)含有多克隆位点区域,可方便的插入目的DNA片段。2)对细菌的可转移性,即在实验中,可将质粒诱导入细菌。3)选择标记。常用的有抗生素抗性基因。这样,一旦质粒进入细菌,便可使该细菌对相应的抗生素产生抵抗能力,在含这一抗生素的琼脂平板上传代,如此,便于鉴定质粒诱导入细菌成功与否。4)在细菌体内可获得较高的拷贝数,例如一种叫pUC的质粒,在单一细菌体中的拷贝数可达500-700个。因此质粒已成为分子生物学中应用最为广泛的载体。 2.λ噬菌体。λ噬菌体的基因组是一组长度约为50kb的双链DNA分子。在λ噬菌体颗粒内,该DNA为一双链分子,其末端为长12个核苷酸的互补单链(粘端)。当λ噬菌体进入宿主细胞后,其粘端通过碱基配对而结合,形成环状分子,相隔12bp有两个交错切口。宿主体内的DNA连接酶很快将切口封闭而形成闭环DNA分子,该DNA分子在感染早期充当转录模板。实验用λ噬菌体,在其DNA的中部有一可取代区,含多克隆位点,供插入DNA之用。λ噬菌体较质粒的优点在于可插入较大的DNA片段,如有的λ噬菌体可插入长达20000bp的外源性DNA。 此外还有粘粒载体、单链丝状噬菌体等等。 (二)分子克隆常用酶 1.限制性内切酶(限制酶)。限制酶能特异性地结合于一段该酶能识别的特殊DNA序列之上或这一DNA附近的特异位点上,并在此切割双链DNA。切割结果可产生两类末端: 1)粘端。许多限制酶在二重对称轴的5′侧切割底物DNA的每条链,则双链DNA交错割开,产生带突出的粘端的DNA片段。例如,PstI识别双链DNA的这样一段序列并切割如下: ↓ 5’N N N N N C T G C A G N N N N N3’ 3’N N N N N G A C G T C N N N N N5’ 切割后产生两片段: ↑ 5’N N N N N C T G C A pG N N N N N3’ 3’N N N N N Gp A C G T C N N N N N5’ 这类限制酶主要有:BamH I、BglⅡ、EcoR I、Hind Ⅲ、Kpn I、Pst I等等。 2)平端。有些限制酶在二重对称轴上同时切割DNA的两条链,则产生带平端的DNA片段。例如:HaeⅢ识别双链DNA的这样一段序列,并切割如下: ↓ 5’N N N N N N G G C C N N N N N N3’ 3’N N N N N N C C G G N N N N N N5’ ↑ 切割后产生平端的片段: 5’N N N N N N G G pC C N N N N N N3’ 3’N N N N N N C Cp G G N N N N N N5’ 这类限制酶主要有:HaeⅢ、Mst I、Sca I、Sma I等等。 2.DNA聚合酶。DNA聚合酶主要用于催化DNA 体外合成反应。这些酶作用时大多需要模板,合成产物的序列与模板互补。最常用DNA聚合酶有PCR用的Taq酶、大肠杆菌DNA聚合酶I(全酶)和大肠杆菌DNA聚合酶I大片段(Klenow片段)等。 3.连接酶。连接酶用于将两段DNA拼接起来,最常用的是T4噬菌体连接酶。 4.脱氧核糖核酸酶I。DNA酶I为内切核酸酶。它优先从嘧啶核苷酸的位置水解双链或单链DNA 。产物为5′端带磷酸基团的单核苷酸及寡核苷酸的混合物。在Mg2+存在下,DNA酶I可独立地存在于每条DNA链且切割位点随机分布。 5.反转录酶。这类酶可以将RNA作为模板合成互补DNA链。 (三)重组载体 有了载体、酶和DNA片段,便可以重组载体。采用某限制酶切割开载体,用DNA连接酶将载体DNA片段与拟插入的目的DNA片段重新连接成一个环状的DNA分子。连接时,插入片段

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