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糖蛋白和糖肽的化学合成
糖蛋白和糖肽的化学合成
;Biosynthesis of N-glycoproteins;Step 1.1Production of GlcNAc-P-P-Dolichol;GlcNAc;Step 1.3 Biosynthesis of the N-Glycan Precursor on Lumenal Leaflet of ER;GlcNAc;GlcNAc;GlcNAc;GlcNAc;a-N-glycosidic asparagine;a-O-glycosidic serine;Lai-Xi Wang的化学生物学合成方法;Lai-Xi Wang的化学生物学合成方法;Lai-Xi Wang的化学生物学合成方法;寡糖结构分析;概述;寡糖结构的要素:
各个单糖的化学结构(什么糖,吡喃还是呋喃)
糖苷键的链接顺序
糖苷键的立体构型;寡糖结构分析中常用的酶法和化学法修饰策略:;Enzymes Useful in detecting Steps in N-glycan Biosynthesis;核磁的结构分析:
核磁信息:
H或者C的化学位移
氢谱: 糖环上多数的H,化学位移位于3.5-4.5之间
Fuc的6位甲基,位于1.1左右
唾液酸的3位次甲基(CH2),位于1.8-2.2之间
anomeric位置,氢原子b-H,一般位于4.5-5; a-H一般位于5-5.5之间
酰胺的甲基位于1.9左右
碳谱: 一般糖环上的碳原子一般位于60-80之间
anomeric的C,一般位于100左右,
a构型的碳原子化学位移数值常小于b构型
C-H,或者H-H的耦合相关(COSY,HSQC,HMBC)
HMBC可以协助判断连接顺序
HSQC可以协助判断6位C和氢原子信号
耦合常数(phase-sensitive的COSY二维谱)(二面角越小,H-H耦合越弱)
多数糖,1,2的氢原子耦合常数为1-4(alpha),或者6-10hz(beta)
半乳糖的4位,和3位以及5位的耦合常数很小很弱
NOE的空间效应(分子量接近2000左右,常使用ROSY谱图)
可以协助判断连接顺序,以及糖苷键构型;;J. Am. Chem. Soc., 2008, 130 (44), pp 14420–14421;Carbohydrate Chemistry Glycobiology;Importance of glycoanalysis;
A. Dell and H. Morris, Science291, 2001;;Carbohydrate Analysis Offers Unique Challenges;Workflow in glycoanalysis;;Glycan analysis;I. Composition analysis Glycan release for monosaccharide composition analysis;I. Composition analysisComposition analysis by (High performance anionic exchange –pulsed amperometric detection) HPAE-PAD;I. Composition analysis Composition analysis by GC-MS;I. Composition analysis Composition analysis by GC-MS;GLC Profile of Alditol Acetates(Supelco SP2330 Column);I. Composition analysis Composition analysis by GC-MS;I.Composition analysisExample;II.Glycan ReleaseEnzymatic (N-glycans);II.Glycan ReleaseEnzymatic (N-glycans);II.Glycan ReleaseEnzymatic (O-glycans);II.Glycan ReleaseChemical;II.Glycan ReleaseChemical (β-Elimination);II.Glycan ReleaseChemical (β-Elimination with BH3.NH3);II.Glycan ReleaseChemical (ammonia-based β-elimination);III.Glycomics;III.Glycomic AnalysisGlycan purification fo
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