第2章蛋白质化学教程方案.ppt

环境科学与工程系 九、多肽链中氨基酸序列分析 1. 分析已纯化蛋白质的氨基酸残基组成 2. 测定多肽链的N端与C端的氨基酸残基 3. 把肽链水解成片段，分别进行分析 4. 测定各肽段的氨基酸排列顺序，一般采用Edman降解法 5. 经过组合排列对比，最终得出完整肽链中氨基酸顺序的结果。 （一）改进的Sanger法 环境科学与工程系 水解肽链的方法及特征 裂解剂 裂解位点 胰蛋白酶 Lys、Arg（C） 胰凝乳蛋白酶 Phe、Tyr、Trp（C） 弹性蛋白酶 Ala、Gly、Ser、Val（C） 胃蛋白酶 Phe、Trp、Tyr（N） 溴化氰 Met（C） 羟胺 Asn—Gly 环境科学与工程系 通过核酸推演的方法 按照三联密码的原则推演出氨基酸的序列 分离编码蛋白质的基因 测定DNA序列 排列出mRNA序列 按照蛋白质的外形可分为球状蛋白质和纤维状蛋白质。 球状蛋白质：globular protein外形接近球形或椭圆形，溶解性较好，能形成结晶，大多数蛋白质属于这一类。 白蛋白、球蛋白、血红蛋白、酶等） 纤维状蛋白质：fibrous protein分子类似纤维或细棒。它又可分为可溶性纤维状蛋白质和不溶性纤维状蛋白质。（胶原蛋白、弹性蛋白、角蛋白和丝蛋白等） 1） 依据蛋白质的外形分类 十、★蛋白质的分类（P17） 环境科学与工程系 按照蛋白质的组成，可以分为 简单蛋白 simple protein 结合蛋白 conjugated protein Protein + 非蛋白质部分（辅基）， 如核蛋白、糖蛋白、脂蛋白、磷蛋白、 金属蛋白、色蛋白。 辅基：包括细胞色素、寡糖、脂类、磷酸、 金属离子、核酸等。 只含由?-氨基酸组成的肽链，不含其它成分。 2） 依据蛋白质的组成分类 3）依据蛋白质的功能分类 酶 调节蛋白——激素 输运和贮存蛋白质 运动蛋白 防御蛋白和毒蛋白 受体蛋白质 支架蛋白 结构蛋白 异常功能 环境科学与工程系 简答： 为什么说蛋白质是生命活动最重要的物质基础？ 简述蛋白质的结构和功能的关系 简述谷胱甘肽的结构特点和功能？ 蛋白质的二级结构有哪几种形式？其要点包括什么？ 5. 简述蛋白质的分类方法？ 名词解释： 氨基酸的等电点及计算公式、必需氨基酸及八种必需氨基酸 氨基酸的分类、蛋白质的一级结构?、肽键和肽链?、肽平面 蛋白质变性与复性、分子病?、盐析法、蛋白质的别构效应 环境科学与工程系 环境科学与工程系 G o H o m e * * * 四級構造 的妙用，可以 血紅蛋白 Hb 與 肌紅蛋白 Mb 的例子說明。 Hb 是四元體，有所謂的四級構造；Mb 為單元體，只有三級構造。Hb 在血中循環，由肺泡中取得氧分子，運送到肌肉中，下載給 Mb。 因此 Hb 必須得知，何時該吸收氧分子，何時該放出；也就是說 Hb 必須有感應氧分子濃度的能力，同時還得做出吸收或放出的動作。這些能力都源自其四級構造的組成。 在靜脈中 Hb 都不載有氧分子，這時候它的四個次體分子都處於一種休息狀態，結合區不容易張開讓 heme 接受氧分子。 當 Hb 循環到肺部時，環境的氧分子濃度提高了，四個次體的任何一個分子接上一個氧分子後，馬上會牽動其它次體，使得其它次體的分子構造舒張，變得很容易接受氧分子。因此在肺部的 Hb 都很容易地滿載氧分子，經動脈輸送至肌肉。若當時肌肉相當勞累，需要大量氧分子的補充，其酸鹼度會降得比較低，Hb 就更容易釋出氧分子，而 Mb 則一昧地吸收 Hb 所下的氧分子，並無調節作用。放下氧分子的 Hb 就回復休息狀態，循著靜脈流回肺部。 蛋白質的構形事實上都不是固定不動，其分子會有某些程度的運動，上述的 Hb 分子也是如此。當其處於休息狀態時，是分子較為緊密的一種構形，稱之為 tense T 型；反之，若其構造較為疏鬆，則基質或其結合對象比較容易進入，稱之為 relaxed R 型。 T 與 R 型的變化，在酵素分子的活性調節也很重要，在酵素部分會繼續提到。 P67 细胞色素c的一级结构与生物进化的关系 亲缘关系越近，其结构越相似----为生物进化提供依据。 虽然各种生物在亲缘关系上差别很大，但与功能密切相关部分的AA序列却有共同处。 环境科学与工程系 1、肌红蛋白与血红蛋白的结构 （二）蛋白质空间结构与功能的关系 环境科学与工程系 Hb与Mb一样能可逆地与O2结合， Hb与O2结合后称为氧合Hb。氧合Hb占总Hb的百分数（称百分饱和度）随O2浓度变化而改变。 2、血红蛋白的构象变化与结合氧 环境科学与工程系 肌红蛋白 Mb 和血红蛋白 Hb 的氧解离曲线 环境科学与工程系 ★协同效应 cooperativity 一个寡聚体蛋白质的一个亚基与其配体结合后，能影响此寡聚体中