药物设计学_QSAR-wj资料.ppt

*;*;*;*;QSAR 发展历史; 1893年，Richet发现一些简单有机物的细胞毒性与其水溶性成反比关系。 在十九、二十世纪之交，Meyer和Overton各自独立的发现，一组有机化合物的麻醉镇定作用与其橄榄油－水分配系数存在相应关系。 Ferguson在1939年提出了挥发性有机物的镇定作用和其在媒介中的相对饱和度之间的热力学相关性. 二十世纪30年代Hammett研究了有机物毒性与分子电性效应(σ)之间的相关性，提出有机物芳环上取代基的电性效应可表示为 σ=log(Kx/Kh) Kx和Kh分别是取代和未取代时化合物的电性常数，而且认为化合物的毒性或麻醉作用与溶解度相关。 二十世纪50年代Taft发展了SAR方法，提出立体参数，把Hammett的思想扩展到脂肪族化合物。指出 Es=log(KS/KH) KS和KH分别是取代衍生物和未取代母体化合物的水解速率常数，即体系分子的空间效应可由化合物的水解速率常数决定。;*;*;*;*;;;*;*;*;*;*;*;*;*;*;对样本（即化合物结构）也有一定的要求，这些要求包括： ;*;*; 氟哌酸是喹诺酮类抗菌药的一类，商品名为诺氟沙星，由古贺弘利用Hansch方程进行了一系列QSAR研究而设计。活性的理论计算值为6.38, 实验值为6.63。这是Hansch方法指导药物设计的成功范例。;*;*;*;*;*;*;*;*;*;*;*;*;*;*;Kubinyi 双线性模型 ;*;*;*;1. 通用资源搜索引擎 通用资源搜索引擎很多，多数已为人们熟知。例如 百度 Google .hk Yahoo http://www. Yahoo. com／science／chemistry lnfoSeek http://www. infoseek. com AltaVista http://www. altavista.digital. com Excite http://www. excite. com Lycos http://www. lycos. com … ;2. 化学资源导航系统 这种导航系统非常多，仅举数例：; 中国科学院化工冶金研究所计算化学开放实验室 化学信息资源导航系统ChIN(新版本) /;中国科学院计算机化学开放实验室中国科学院上海有机化学研究所 16/hxwzdh.htm; 美国加州大学洛杉矶分校(UCLA)化学和生物化学系 /chempointers.html 从该网站提供的链???, 可以很快找到大量的化学信息.; 在化学信息数据库中, 化学结构数据库占有很大的比例。如果熟悉这些网站或数据库，不必使用搜索引擎就可直接链接。本节摘要介绍，以供参考。;美国国家标准与技术研究院（NIST）开发: Chemistry WebBook /chemistry/; 印第安纳大学分子结构中心 / 晶体结构和分子图来源; 中国科学院计算机化学开放实验室 16/molinformatics.htm; 曼彻斯特大学-结构化学部 http://spec.ch.man.ac.uk/Structural_Chemistry.html; Ponder实验室WWW服务器 / 主要内容为计算化学与分子模型; 维也纳大学-理论化学学院 http://www.itc.univie.ac.at/; 辛辛那提大学-OBR计算机辅助分子设计中心 ; 乔治亚大学-计算量子化学中心 /; 国际晶体学联合会 http://www.iucr.ac.uk/;剑桥晶体结构数据中心 http://www.ccdc.cam.ac.uk ;布鲁克海文蛋白质数据库 /pdb/ 蛋白质、DNA、RNA、病毒、碳水化合物等生物大分子的3D结构数据库，含原子坐标、一级序列与二级结构信息、晶体结构因子和2D –NMR数据.;美国矿物学家晶体结构数据库/xtal-cgi/test;矿物结构数据库 http://database.iem.ac.ru/mincryst/search.php3 矿物的晶体结构参数和衍射资料，可由化学式首字母、晶体结构等