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第二章 蛋白质的共价结构;蛋白质通论蛋白质的化学组成和分类;蛋白质含量的测定——凯氏定氮法;单纯蛋白质的分类; 结合蛋白质的分类;蛋白质分子的形状和大小根据形状和溶解度分为三大类:;蛋白质的大小;估算氨基酸残基数目;蛋白质功能的多样性;蛋白质功能的多样性; 二.肽; ;肽与肽键;肽与肽键; ; 肽键平面;不可能的空间构象; ; ;;谷胱甘肽;二硫键; ;A.样品必需纯(97%以上);
B.知道蛋白质的分子量;
C.知道蛋白质由几个亚基组成;
D.测定蛋白质的氨基酸组成;并根据分子量计算每种氨基酸的个数。
E.测定水解液中的氨量,计算酰胺的含量。; ; ; ;肼解法:此法是多肽链C-端氨基酸分析法。多肽与肼在无水条件下加热,C-端氨基酸即从肽链上解离出来,其余的氨基酸则变成肼化物,即(n-1)个氨基酸酰肼。肼化物能够与苯甲醛缩合成不溶于水的物质而与C-端氨基酸分离。;D.氨肽酶法:氨肽酶是一种肽链外切酶,它能从多肽链的N-端逐个的向里水解。根据不同的反应时间测出酶水解所释放出的氨基酸种类和数量,按反应时间和氨基酸残基释放量作动力学曲线,从而知道蛋白质的N-末端残基顺序。最常用的氨肽酶是亮氨酸氨肽酶,水解以亮氨酸残基为N-末端的肽键速度最大。; ;酶解法:胰蛋白酶,糜蛋白酶,胃蛋白酶,嗜热菌蛋白酶,羧肽酶和氨肽酶
化学法:溴化氰水解法,它能选择性地切割由甲硫氨酸的羧基所形成的肽键。;7.测定每个肽段的氨基酸顺序。
8.确定肽段在多肽链中的次序:利用两套或多套肽段的氨基酸顺序彼此间的交错重叠,拼凑出整条多肽链的氨基酸顺序。
9.确定原多肽链中二硫键的位置:一般采用胃蛋白酶处理没有断开二硫键的多肽链,再利用双向电泳技术分离出各个肽段,用过甲酸处理后,将每个肽段进行组成及顺序分析,然后同其它方法分析的肽段进行比较,确定二硫键的位置。;蛋白质一级结构测定的步骤;蛋白质序列数据库;四.蛋白质的氨基酸序列 与生物功能;细胞色素C;细胞色素C 系统树(进化树);
同源蛋白具有共同的进化起源
肌红蛋白(Myoglobin,Mb ):哺乳动物的肌肉中储存氧气的蛋白质,水生的哺乳动物体内尤为发达(如鲸鱼),因此,它们可以憋气很长时间,研究用Mb一般由鲸鱼提供。一级结构:单条肽链,153个aa,其中的83个aa为保守序列(即同源蛋白质均相同,是决定功能的最重要序列),含有一分子血红素辅基,其中保持Fe2+,血红素通过Fe2+以配位键吊在肽链的His的咪唑基上。O2将结合在Fe2+上。
血红蛋白(Hemoglobin,Hb ) :四聚体,一级结构:4条链,α2β2。α141,β146,每条肽链都结合着一分子的血红素,每条肽链都有保守序列。
血液凝固与氨基酸序列的局部断裂
;肌红蛋白(Myoglobin,Mb )和血红蛋白(Hemoglobin,Hb ) ;五. 肽和蛋白质的人工合成; 固相肽合成(solid-phase peptide synthesis);本章小结
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