07-硕士生课-后基因组学-章跃陵-转录组学答案.pptVIP

Chapter 7 转录组学; 一、产生背景 ;二、概念;●转录组与基因组的区别;三、主要研究技术及应用;2、抑制消减杂交（SSH）;如：国家海洋局第三海洋研究所徐洵研究小组以日本对虾Penaeus japonicus为研究对象，运用抑制性消减杂交技术分别在WSSV抗性对虾和病原菌注射对虾体内发现了35种与WSSV抗性有关的基因和25种与病原菌应激性有关的基因（He NH et al.，2003；Pan D et al.，2005）。 中山大学何建国研究小组以WSSV抗性和易感性凡纳滨对虾Litopenaeus vannamei 为研究对象，采用抑制性消减杂交技术鉴定了40种与WSSV抗性相关的基因，其中漆酶、羧肽酶B、凝集素、锌指蛋白酶等30种蛋白表达上升，而另外10种基因表达下降（Zhao Z Y et al.，2007）。;3、基因表达序列分析（SAGE）; 如Kenneth利用自己发明的SAGE技术将已扩散到肝脏的克隆癌细胞的基因表达与那些未扩散的和正常克隆细胞的基因表达相比较,发现???一个酪氨酸磷酯酶(phospha- tase of rvegenerating liver,PRL)促进了基因的表达,过量PRL酶帮助了癌细胞扩散。;4、基因芯片（DNA microarray）;如中国科学院海洋研究所项建海研究小组运用cDNA微列阵技术发现WSSV人工感染或自然感染中国对虾Penaeus chinensis后，一部分免疫相关基因如热休克蛋白（heat shock proteins,HSP70 和 HSP90）、磷酸海藻糖合成酶（trehalose-phosphatesynthase ,TPS）等表达上升，而另一部分基因如ATP合成酶A链、精氨酸激酶等表达下降（Wang B et al., 2006）。;5、RNA测序（RNA_seq）技术