2蛋白质序列特征分析~生物信息学分析.pptVIP

序列特征分析;蛋白质的一级结构;蛋白质的二级结构;蛋白质分子只有处于它自己特定的空间结构情况下，才能获得它特定的生物活性，空间结构稍有破坏，就很可能会导致蛋白质生物活性的降低甚至丧失，因为它们的特定的结构允许它们结合特定的配体分子。; 对DNA序列和蛋白质序列进行序列特征分析，能够使我们从分子层次上了解基因的结构特点，了解与基因表达调控相关的信息，了解DNA序列与蛋白质序列之间的编码，了解蛋白质序列与蛋白质空间结构之间的关系和规律，为进一步研究了解蛋白质功能与蛋白质结构之间的关系提供理论依据。 ;二、蛋白质序列特征分析;1、蛋白质的理化性质 ;利用PROTPARAM分析蛋白质的理化性质 ;PROTPARAM在线页面 ;用PROTPARAM分析G00016序列理化性质的结果 ;2、蛋白质的亲水性或疏水性;蛋白质的亲水性或疏水性;利用PROTSCALE分析蛋白质的亲水性或疏水性 ;PROTSCALE在线页面 ;用PROTSCALE分析P02699序列疏水性结果的图形显示 ;HOHOB./KYTE DOOLITTLE标度 ;用WINDOW SIZE=13时计算窗口内每个位置上氨基酸的标度权值 ;3、蛋白质的跨膜区;蛋白质的跨膜区;利用TMPRED分析蛋白质的跨膜区 ;TMPRED在线网页 ;用TMPRED分析P51684序列所得到的可能的7个跨膜螺旋