外显子捕获要点.pptx

外显子捕获外显子是真核生物基因的一部分，它在剪接后仍会被保存下来，并可在蛋白质生物合成过程中被表达为蛋白质。在人类基因中大约有180,000个外显子，占人类基因组的1%，约30MB。人类基因组的蛋白编码区域大约包含85%的致病突变。外显子测序是指利用序列捕获技术将全基因组外显子区域DNA捕捉并富集后进行高通量测序的基因组分析方法。是一种选择基因组的编码序列的高效策略，外显子测序相对于基因组重测序成本较低，对研究已知基因的SNP、Indel等具有较大的优势。对肿瘤基因突变检测具有显著意义，因为外显子测序容易提高深度，可以轻易达到100X、200X。而因为外显子捕获是有偶然性的，对小片段结构变异、拷贝数变异很难检测。SeqCapEZHumanExomeLibraryv3.0（Roche）SureSelectXTHumanAllExonV6（Agilent）TruSeq Exome Library Prep Kit （Illumina）TruSeq RapidExome Library Prep Kit（Illumina）罗氏2008年推出NimbleGen序列捕获2.1M外显子组芯片，随之在2009年底推出的EZ外显子组序列捕获能提供液相的工作流程并以DNA液相探针杂交来捕获目的片段。SeqCapEZHumanExomeLibrary使用高密度探针的方法，主要是利用杂交和DNA微阵