第十一章微生物分类要点.pptVIP

第十章 微生物的分类和鉴定 第一节 微生物分类的单位与命名 第二节 微生物分类的依据与方法 第三节 微生物的分类系统 第一节 微生物的分类单位与命名 一、微生物的分类单位 二、微生物的命名 域（Domain） 界 Kingdom 门 Phylum（或Division）——亚门 纲 Class ——亚纲 目 Order ——亚目 科 Family ——亚科 ——族 ——亚族 属 Genus 种 Species 微生物的分类单位 种是最基本的分类单位。 但分类单元之间可加入亚门、亚纲、亚目、亚科等次要分类单位。种以下又可分为亚种、变种、型、菌株等 种（Species）： 种是一个基本分类单位，是一大群表型特征高度相似、亲缘关系极其接近、与同属内其他种有明显差异的菌株的总称。即是以某个“典型菌株”为代表、十分类似的菌株的总称。1987年，国际细菌分类委员会颁布，DNA同源≧ 70%，而且其Tm≦5oC的菌群为一个种 在微生物中，一个种只能用该种内的一个典型菌株作为具体标本，它就是该种的模式种。 种以下的分类单元 亚种（subspeciers）或变种（variety）：种的进一步细分，一般指其少数几个稳定的变异特征或遗传性状与模式种不同。 型 （type）：同一细菌种内显示很小生物化学与生物学差异的菌株。 菌株（strain）：表示任何由一个独立分离的单细胞繁殖而来的纯种群体（clone）及其一切后代；实际上是一个微生物达到遗传性纯的标志。（是指同种微生物不同来源的纯培养物即单个分离物的纯培养后代，常以数字、字母、人命或地名等表示 ） 学名：菌种的科学名称。菌种的学名是按照《国际细菌命名法规》命名的国际学术界公认，并通用的名称。 命名原则：双命名法 学名=属名+种名 规定与常识：属名应大写首字母、单数。种名加词代表一个种的次要特征，首字小写，学名用斜体书写。 微生物的命名按国际命名法命名，即Linna所创立的“双命名法” 例：Staphylococcus aureus 属名：葡萄球菌 种名：金黄色 微 生 物 的 命 名 Bacillus sp 微生物分类的依据与方法 形 态 特 征：个体形态（形状、大小、染色反应等）、群体形态（菌落特征、液体培养特点等） 生理生化特征：代谢产物、营养要求、细胞壁成分等的测定 生态特征：微生物间各种相互关系的利用 遗传特征：DNA同源性分析 G+C的含量 其它：全细胞蛋白的分析、多位点酶的分析等 一、分类的依据 二、分类的方法 经典分类法：采用双歧法整理实验结果 数值分类法：测定100项以上的各种性状，利用计算机进行菌株的相互比较，并得出总的相似值。一般认为同种微生物菌株之间的相似值≧80%。 遗传分类法：DNA杂交（液相复性速率法原理与方法）、G+C含量的测定（热变性法、浮力密度法等） 微生物的分类系统 二界系统、三界系统、四界系统、五界系统、六界系统和三域学说 20世纪70年代,美国的 C.R.Woese 提出三域学说（Three Domain Theory），目前获得国际学术界的基本肯定。三域系统包括：细菌域 (Bacteria ) 、古生菌域 (Archaea)、 真核生物域 (Eucaryotes)。 (周德庆 2/E 346-) The five-Kingdom system (Whittaker) is not accepted by many biologists. A major problem is its lack of distinction between archaea and bacteria.??? (Prescott 5/E 439) Fungi Plants Animals Protista Prokaryotae Five-kingdom system is a commonly accepted system of classification Archaea bacteria Eukarya 微生物的常用分类系统 细菌：伯杰氏细菌学鉴定手册（第八、第九版）、细菌系统学手册（第一版） 放线菌：中国科学院微生物研究所编著的放线菌目分科、分属检索表 真菌：Smith、 Alexopoulos 、 Ainsworth的分类系统 真菌的分类 真菌是生物界的一大类微生物，具有独自的特点和起源，种类极多，已知的真菌有5万种，估计总数在10-25万种以上，真菌的分类系统较多，其中Answorth、Martin、Smith、A