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多聚核苷酸是通过一个核苷酸的C3’-OH 与另一分子核苷酸的5’-磷酸基形成3’,5’-磷酸二酯键相连而成的链状聚合物。 5′-磷酸端(常用5’-P表示);3′-羟基端(常用3’-OH表示) 多聚核苷酸链具有方向性,当表示一个多聚核苷酸链时,必须注明它的方向是5′→3′或是3′→5′。 磷酸二酯键(phosphodiester bond)也称为“3,5-磷酸二酯键”或“磷酸双酯键”,是核酸分子中的磷酸基团的磷原子与另外两个五碳糖分子的碳原子之间形成的共价键。这种形式的键结于DNA及RNA分子中负责将分别位于两个核糖上的3号碳与5号碳连结起来。 第二讲 遗传的物质基础-DNA 主要内容: 一、DNA的基本特点 二、DNA的一级结构 三、DNA的二级结构 四、DNA二级结构的多形性 五、DNA的高级结构 第一节 DNA的基本特点(P25页)1) 在体细胞中含量稳定(结构特点)2) 在生殖细胞中含量减半(减数分裂)3) 能携带遗传信息(两大类)4) 能精确地自我复制(半保留复制)5) 能产生可遗传的变异(碱基缺失等) 主要体现在戊核糖的 第二个碳原子上的基团,前者是羟基,后者是氢原子 图2-1 RNA与DNA组成结构上的差异 磷酸二酯键(phosphodiester bond) 也称为“3,5-磷酸二酯键”或“磷酸双酯键”,是核酸分子中的磷酸基团的磷原子与另外两个五碳糖分子的碳原子之间形成的共价键。 第二节 DNA的一级结构 1. 概念: DNA的一级结构就是4种核苷酸的连接及其排列顺序,表明了DNA的化学构成。 2. 意义: a. 以密码子的方式蕴藏了遗传信息。 b. 决定了DNA的二级结构和高级结构。 多聚GC区段: (分子遗传学P17的翻板假说) 右手螺旋在多聚GC区段容易转变成左手螺旋 反向重复序列(inverted repeats):回文序列(Palindrome) 较短的:特别信号 限制性内切核酸酶的识别位点 较长的:形成发夹结构 转录终止作用 tRNA三叶草形二级结构 图2-2 反向重复序列示意图 呼吸作用 富含A/T序列区段:双链 单链泡状结构 复制和翻译 嘌呤和嘧啶的排列顺序对双螺旋结构稳定性具有不同影响: 第三节 DNA的二级结构 1. 概念: DNA的二级结构是指两条多核苷酸链反向平行盘绕所生成的双螺旋结构 2. DNA右手双螺旋结构模型: a. 模型的提出: 1953年,Watson和Crick提出DNA的反向平行的右手双螺旋模型 图2-3 Watson和Crick的工作场景 1962年, Wilkins、 Watson和Crick共获诺贝尔化学奖。 图2-4 b.模型的基本要点: (1) 主链:两条反向平行的多核苷酸主链组成了DNA的双螺旋,螺旋的直径是2nm。主链处于双螺旋的外侧,碱基对与轴线垂直,排列在内侧。 (2) 碱基对:碱基对通过氢键结合,遵循嘌呤和嘧啶碱基配对原则,A和T配对,G和C配对。 (3) 螺距:1个螺距是3.4nm,包含10个核苷酸。 (4) 大沟和小沟:DNA双螺旋模型中有大沟(major or wide groove)和小沟(minor or narrow groove)的存在。大沟是蛋白质识别遗传信息的重要场所。 图2-5 B型DNA双螺旋的结构特征 3.决定DNA二级结构稳定性的因素: (1) 碱基对之间的氢键作用。 G/C对之间有3条氢键,A/T对之间有2条氢键。这是DNA双螺旋结构的重要特征之一,DNA的许多性质均与此有关。如Tm值的高低可能与此有关。 图2-6 两条多核酸链间氢键相连 (2) 碱基的堆集力。 它包括: ① 疏水作用:是不溶于水或难溶于水的两个分子在水中具有相互联合,成串结合在一起的趋势。在DNA双螺旋结构中,嘌呤环和嘧啶环本身带有一定程度的疏水性,因而DNA相邻碱基就有相互堆积在一起的趋势。 ② 范德华力:DNA链中大量的嘌呤环和嘧啶环间积累的范德华力是相当可观的,这是构成碱基堆积力的另一重要因素。 (3) 带负电荷的磷酸基的静电斥力。 这是由于每一个核苷酸的磷酸基上都带有一个负电荷;如果这些负电荷没有被中和,双链之间的这种强有力的静电排斥作用将驱使两条链分开。但是,当有盐类加入时,带负电荷的磷酸基团可
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